Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc2Q9CQP2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc2Q9CQP2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc2Q9CQP2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc2Q9CQP2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc2Q9CQP2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc2Q9CQP2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc2Q9CQP2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc2Q9CQP2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc2Q9CQP2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc2Q9CQP2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc2Q9CQP2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc2Q9CQP2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc2Q9CQP2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc2Q9CQP2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc2Q9CQP2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc2Q9CQP2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc2Q9CQP2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc2Q9CQP2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc2Q9CQP2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc2Q9CQP2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc2Q9CQP2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc2Q9CQP2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc2Q9CQP2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc2Q9CQP2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc2Q9CQP2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc2Q9CQP2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc2Q9CQP2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc2Q9CQP2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc2Q9CQP2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms