Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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