Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nudt21Q9CQF3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nudt21Q9CQF3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nudt21Q9CQF3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nudt21Q9CQF3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nudt21Q9CQF3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nudt21Q9CQF3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nudt21Q9CQF3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nudt21Q9CQF3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nudt21Q9CQF3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nudt21Q9CQF3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Nudt21Q9CQF3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nudt21Q9CQF3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nudt21Q9CQF3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nudt21Q9CQF3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nudt21Q9CQF3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nudt21Q9CQF3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nudt21Q9CQF3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nudt21Q9CQF3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nudt21Q9CQF3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nudt21Q9CQF3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nudt21Q9CQF3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nudt21Q9CQF3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nudt21Q9CQF3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nudt21Q9CQF3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nudt21Q9CQF3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nudt21Q9CQF3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nudt21Q9CQF3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nudt21Q9CQF3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nudt21Q9CQF3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nudt21Q9CQF3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nudt21Q9CQF3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nudt21Q9CQF3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nudt21Q9CQF3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nudt21Q9CQF3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nudt21Q9CQF3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nudt21Q9CQF3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nudt21Q9CQF3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nudt21Q9CQF3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Nudt21Q9CQF3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nudt21Q9CQF3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nudt21Q9CQF3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nudt21Q9CQF3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nudt21Q9CQF3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nudt21Q9CQF3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nudt21Q9CQF3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nudt21Q9CQF3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nudt21Q9CQF3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nudt21Q9CQF3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nudt21Q9CQF3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nudt21Q9CQF3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nudt21Q9CQF3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nudt21Q9CQF3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nudt21Q9CQF3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nudt21Q9CQF3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nudt21Q9CQF3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nudt21Q9CQF3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nudt21Q9CQF3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nudt21Q9CQF3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nudt21Q9CQF3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nudt21Q9CQF3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nudt21Q9CQF3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nudt21Q9CQF3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nudt21Q9CQF3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nudt21Q9CQF3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nudt21Q9CQF3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nudt21Q9CQF3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nudt21Q9CQF3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nudt21Q9CQF3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nudt21Q9CQF3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nudt21Q9CQF3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nudt21Q9CQF3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nudt21Q9CQF3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nudt21Q9CQF3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nudt21Q9CQF3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nudt21Q9CQF3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nudt21Q9CQF3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nudt21Q9CQF3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nudt21Q9CQF3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nudt21Q9CQF3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nudt21Q9CQF3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nudt21Q9CQF3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nudt21Q9CQF3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nudt21Q9CQF3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nudt21Q9CQF3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nudt21Q9CQF3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nudt21Q9CQF3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nudt21Q9CQF3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nudt21Q9CQF3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nudt21Q9CQF3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nudt21Q9CQF3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nudt21Q9CQF3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nudt21Q9CQF3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nudt21Q9CQF3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nudt21Q9CQF3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nudt21Q9CQF3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nudt21Q9CQF3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nudt21Q9CQF3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nudt21Q9CQF3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nudt21Q9CQF3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms