Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkp2Q9CQ73 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkp2Q9CQ73 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkp2Q9CQ73 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkp2Q9CQ73 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkp2Q9CQ73 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkp2Q9CQ73 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkp2Q9CQ73 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkp2Q9CQ73 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkp2Q9CQ73 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkp2Q9CQ73 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkp2Q9CQ73 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkp2Q9CQ73 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkp2Q9CQ73 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkp2Q9CQ73 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkp2Q9CQ73 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkp2Q9CQ73 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pkp2Q9CQ73 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pkp2Q9CQ73 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pkp2Q9CQ73 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pkp2Q9CQ73 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pkp2Q9CQ73 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pkp2Q9CQ73 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pkp2Q9CQ73 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pkp2Q9CQ73 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pkp2Q9CQ73 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pkp2Q9CQ73 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Pkp2Q9CQ73 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pkp2Q9CQ73 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pkp2Q9CQ73 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkp2Q9CQ73 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkp2Q9CQ73 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pkp2Q9CQ73 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pkp2Q9CQ73 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkp2Q9CQ73 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkp2Q9CQ73 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkp2Q9CQ73 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkp2Q9CQ73 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkp2Q9CQ73 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkp2Q9CQ73 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkp2Q9CQ73 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkp2Q9CQ73 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkp2Q9CQ73 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkp2Q9CQ73 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkp2Q9CQ73 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkp2Q9CQ73 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkp2Q9CQ73 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkp2Q9CQ73 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkp2Q9CQ73 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Pkp2Q9CQ73 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkp2Q9CQ73 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkp2Q9CQ73 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkp2Q9CQ73 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkp2Q9CQ73 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkp2Q9CQ73 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkp2Q9CQ73 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkp2Q9CQ73 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkp2Q9CQ73 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkp2Q9CQ73 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkp2Q9CQ73 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkp2Q9CQ73 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkp2Q9CQ73 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkp2Q9CQ73 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkp2Q9CQ73 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkp2Q9CQ73 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkp2Q9CQ73 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkp2Q9CQ73 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkp2Q9CQ73 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkp2Q9CQ73 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pkp2Q9CQ73 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pkp2Q9CQ73 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pkp2Q9CQ73 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pkp2Q9CQ73 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pkp2Q9CQ73 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pkp2Q9CQ73 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pkp2Q9CQ73 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pkp2Q9CQ73 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pkp2Q9CQ73 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkp2Q9CQ73 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkp2Q9CQ73 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkp2Q9CQ73 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkp2Q9CQ73 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkp2Q9CQ73 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkp2Q9CQ73 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkp2Q9CQ73 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkp2Q9CQ73 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkp2Q9CQ73 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkp2Q9CQ73 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkp2Q9CQ73 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkp2Q9CQ73 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkp2Q9CQ73 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkp2Q9CQ73 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkp2Q9CQ73 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkp2Q9CQ73 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkp2Q9CQ73 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkp2Q9CQ73 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkp2Q9CQ73 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkp2Q9CQ73 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkp2Q9CQ73 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkp2Q9CQ73 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms