Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700029P11RikQ9CQ68 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700029P11RikQ9CQ68 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700029P11RikQ9CQ68 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms