Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Bhlhe41Q99PV5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Bhlhe41Q99PV5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms