Protein–RNA interactions for Protein: Q99PD7

Slc24a3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc24a3Q99PD7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc24a3Q99PD7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc24a3Q99PD7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Slc24a3Q99PD7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc24a3Q99PD7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc24a3Q99PD7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc24a3Q99PD7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc24a3Q99PD7 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc24a3Q99PD7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc24a3Q99PD7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc24a3Q99PD7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc24a3Q99PD7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc24a3Q99PD7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc24a3Q99PD7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc24a3Q99PD7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc24a3Q99PD7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc24a3Q99PD7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc24a3Q99PD7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc24a3Q99PD7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc24a3Q99PD7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc24a3Q99PD7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc24a3Q99PD7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc24a3Q99PD7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc24a3Q99PD7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc24a3Q99PD7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc24a3Q99PD7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc24a3Q99PD7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc24a3Q99PD7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc24a3Q99PD7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc24a3Q99PD7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc24a3Q99PD7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc24a3Q99PD7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc24a3Q99PD7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc24a3Q99PD7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc24a3Q99PD7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc24a3Q99PD7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc24a3Q99PD7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc24a3Q99PD7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc24a3Q99PD7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc24a3Q99PD7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc24a3Q99PD7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc24a3Q99PD7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc24a3Q99PD7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc24a3Q99PD7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc24a3Q99PD7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc24a3Q99PD7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc24a3Q99PD7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc24a3Q99PD7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc24a3Q99PD7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc24a3Q99PD7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms