Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Nup155Q99P88 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Nup155Q99P88 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Nup155Q99P88 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Nup155Q99P88 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Nup155Q99P88 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Nup155Q99P88 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Nup155Q99P88 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Nup155Q99P88 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Nup155Q99P88 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Nup155Q99P88 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Nup155Q99P88 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Nup155Q99P88 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Nup155Q99P88 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Nup155Q99P88 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Nup155Q99P88 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Nup155Q99P88 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Nup155Q99P88 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Nup155Q99P88 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Nup155Q99P88 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Nup155Q99P88 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Nup155Q99P88 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Nup155Q99P88 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Nup155Q99P88 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Nup155Q99P88 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Nup155Q99P88 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Nup155Q99P88 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Nup155Q99P88 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Nup155Q99P88 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Nup155Q99P88 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Nup155Q99P88 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
Nup155Q99P88 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Nup155Q99P88 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Nup155Q99P88 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Nup155Q99P88 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Nup155Q99P88 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Nup155Q99P88 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Nup155Q99P88 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Nup155Q99P88 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Nup155Q99P88 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Nup155Q99P88 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Nup155Q99P88 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Nup155Q99P88 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Nup155Q99P88 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Nup155Q99P88 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Nup155Q99P88 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Nup155Q99P88 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Nup155Q99P88 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Nup155Q99P88 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Nup155Q99P88 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Nup155Q99P88 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Nup155Q99P88 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Nup155Q99P88 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Nup155Q99P88 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Nup155Q99P88 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Nup155Q99P88 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Nup155Q99P88 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Nup155Q99P88 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Nup155Q99P88 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Nup155Q99P88 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Nup155Q99P88 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
Nup155Q99P88 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Nup155Q99P88 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Nup155Q99P88 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Nup155Q99P88 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Nup155Q99P88 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Nup155Q99P88 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Nup155Q99P88 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Nup155Q99P88 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Nup155Q99P88 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Nup155Q99P88 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Nup155Q99P88 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Nup155Q99P88 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Nup155Q99P88 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Nup155Q99P88 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Nup155Q99P88 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Nup155Q99P88 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Nup155Q99P88 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Nup155Q99P88 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Nup155Q99P88 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Nup155Q99P88 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Nup155Q99P88 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Nup155Q99P88 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Nup155Q99P88 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Nup155Q99P88 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Nup155Q99P88 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Nup155Q99P88 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Nup155Q99P88 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Nup155Q99P88 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Nup155Q99P88 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Nup155Q99P88 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Nup155Q99P88 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Nup155Q99P88 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Nup155Q99P88 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Nup155Q99P88 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Nup155Q99P88 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Nup155Q99P88 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Nup155Q99P88 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Nup155Q99P88 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Nup155Q99P88 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms