Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rtn4Q99P72 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rtn4Q99P72 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rtn4Q99P72 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rtn4Q99P72 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rtn4Q99P72 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rtn4Q99P72 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rtn4Q99P72 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rtn4Q99P72 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rtn4Q99P72 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rtn4Q99P72 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rtn4Q99P72 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rtn4Q99P72 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rtn4Q99P72 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rtn4Q99P72 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rtn4Q99P72 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Rtn4Q99P72 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rtn4Q99P72 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rtn4Q99P72 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rtn4Q99P72 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rtn4Q99P72 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Rtn4Q99P72 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rtn4Q99P72 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rtn4Q99P72 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rtn4Q99P72 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rtn4Q99P72 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rtn4Q99P72 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rtn4Q99P72 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rtn4Q99P72 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rtn4Q99P72 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rtn4Q99P72 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rtn4Q99P72 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rtn4Q99P72 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rtn4Q99P72 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rtn4Q99P72 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rtn4Q99P72 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rtn4Q99P72 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rtn4Q99P72 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rtn4Q99P72 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rtn4Q99P72 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rtn4Q99P72 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rtn4Q99P72 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rtn4Q99P72 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rtn4Q99P72 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rtn4Q99P72 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rtn4Q99P72 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rtn4Q99P72 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rtn4Q99P72 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rtn4Q99P72 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rtn4Q99P72 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rtn4Q99P72 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rtn4Q99P72 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rtn4Q99P72 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Rtn4Q99P72 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rtn4Q99P72 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rtn4Q99P72 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rtn4Q99P72 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rtn4Q99P72 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rtn4Q99P72 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rtn4Q99P72 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rtn4Q99P72 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rtn4Q99P72 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rtn4Q99P72 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rtn4Q99P72 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rtn4Q99P72 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rtn4Q99P72 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rtn4Q99P72 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rtn4Q99P72 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rtn4Q99P72 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rtn4Q99P72 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rtn4Q99P72 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rtn4Q99P72 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rtn4Q99P72 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rtn4Q99P72 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Rtn4Q99P72 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rtn4Q99P72 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rtn4Q99P72 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rtn4Q99P72 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rtn4Q99P72 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rtn4Q99P72 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rtn4Q99P72 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rtn4Q99P72 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rtn4Q99P72 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rtn4Q99P72 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rtn4Q99P72 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rtn4Q99P72 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rtn4Q99P72 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rtn4Q99P72 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rtn4Q99P72 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rtn4Q99P72 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rtn4Q99P72 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rtn4Q99P72 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rtn4Q99P72 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rtn4Q99P72 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Rtn4Q99P72 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rtn4Q99P72 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rtn4Q99P72 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rtn4Q99P72 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rtn4Q99P72 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rtn4Q99P72 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms