Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2ird2Q99NI3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2ird2Q99NI3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2ird2Q99NI3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2ird2Q99NI3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2ird2Q99NI3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2ird2Q99NI3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2ird2Q99NI3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2ird2Q99NI3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2ird2Q99NI3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2ird2Q99NI3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2ird2Q99NI3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2ird2Q99NI3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2ird2Q99NI3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2ird2Q99NI3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2ird2Q99NI3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2ird2Q99NI3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2ird2Q99NI3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf2ird2Q99NI3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf2ird2Q99NI3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf2ird2Q99NI3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf2ird2Q99NI3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf2ird2Q99NI3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf2ird2Q99NI3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2ird2Q99NI3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2ird2Q99NI3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2ird2Q99NI3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2ird2Q99NI3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2ird2Q99NI3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2ird2Q99NI3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2ird2Q99NI3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2ird2Q99NI3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2ird2Q99NI3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2ird2Q99NI3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2ird2Q99NI3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2ird2Q99NI3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2ird2Q99NI3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2ird2Q99NI3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf2ird2Q99NI3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2ird2Q99NI3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2ird2Q99NI3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2ird2Q99NI3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2ird2Q99NI3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2ird2Q99NI3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2ird2Q99NI3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2ird2Q99NI3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2ird2Q99NI3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2ird2Q99NI3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2ird2Q99NI3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2ird2Q99NI3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2ird2Q99NI3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2ird2Q99NI3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms