Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bco2Q99NF1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bco2Q99NF1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bco2Q99NF1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bco2Q99NF1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bco2Q99NF1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bco2Q99NF1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bco2Q99NF1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bco2Q99NF1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bco2Q99NF1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bco2Q99NF1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bco2Q99NF1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bco2Q99NF1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bco2Q99NF1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bco2Q99NF1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bco2Q99NF1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bco2Q99NF1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bco2Q99NF1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Bco2Q99NF1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bco2Q99NF1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bco2Q99NF1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bco2Q99NF1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bco2Q99NF1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bco2Q99NF1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bco2Q99NF1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bco2Q99NF1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bco2Q99NF1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bco2Q99NF1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bco2Q99NF1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bco2Q99NF1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bco2Q99NF1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bco2Q99NF1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bco2Q99NF1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bco2Q99NF1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bco2Q99NF1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bco2Q99NF1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bco2Q99NF1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bco2Q99NF1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bco2Q99NF1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bco2Q99NF1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bco2Q99NF1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bco2Q99NF1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bco2Q99NF1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bco2Q99NF1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bco2Q99NF1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bco2Q99NF1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bco2Q99NF1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bco2Q99NF1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Bco2Q99NF1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bco2Q99NF1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bco2Q99NF1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bco2Q99NF1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bco2Q99NF1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bco2Q99NF1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bco2Q99NF1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bco2Q99NF1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bco2Q99NF1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bco2Q99NF1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Bco2Q99NF1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Bco2Q99NF1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Bco2Q99NF1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bco2Q99NF1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bco2Q99NF1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bco2Q99NF1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bco2Q99NF1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bco2Q99NF1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bco2Q99NF1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bco2Q99NF1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bco2Q99NF1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bco2Q99NF1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bco2Q99NF1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Bco2Q99NF1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bco2Q99NF1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Bco2Q99NF1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bco2Q99NF1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bco2Q99NF1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bco2Q99NF1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bco2Q99NF1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bco2Q99NF1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bco2Q99NF1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bco2Q99NF1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bco2Q99NF1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bco2Q99NF1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bco2Q99NF1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bco2Q99NF1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Bco2Q99NF1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bco2Q99NF1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bco2Q99NF1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bco2Q99NF1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bco2Q99NF1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bco2Q99NF1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bco2Q99NF1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bco2Q99NF1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bco2Q99NF1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bco2Q99NF1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bco2Q99NF1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bco2Q99NF1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bco2Q99NF1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bco2Q99NF1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bco2Q99NF1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms