Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Rnf17Q99MV7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Rnf17Q99MV7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Rnf17Q99MV7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Rnf17Q99MV7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Rnf17Q99MV7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Rnf17Q99MV7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Rnf17Q99MV7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Rnf17Q99MV7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Rnf17Q99MV7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Rnf17Q99MV7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Rnf17Q99MV7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Rnf17Q99MV7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Rnf17Q99MV7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rnf17Q99MV7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rnf17Q99MV7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rnf17Q99MV7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Rnf17Q99MV7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Rnf17Q99MV7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Rnf17Q99MV7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Rnf17Q99MV7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Rnf17Q99MV7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Rnf17Q99MV7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Rnf17Q99MV7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Rnf17Q99MV7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Rnf17Q99MV7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Rnf17Q99MV7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Rnf17Q99MV7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Rnf17Q99MV7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Rnf17Q99MV7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Rnf17Q99MV7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Rnf17Q99MV7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rnf17Q99MV7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rnf17Q99MV7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rnf17Q99MV7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rnf17Q99MV7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rnf17Q99MV7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rnf17Q99MV7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rnf17Q99MV7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rnf17Q99MV7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rnf17Q99MV7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Rnf17Q99MV7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rnf17Q99MV7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rnf17Q99MV7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rnf17Q99MV7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rnf17Q99MV7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rnf17Q99MV7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Rnf17Q99MV7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rnf17Q99MV7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rnf17Q99MV7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rnf17Q99MV7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rnf17Q99MV7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rnf17Q99MV7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rnf17Q99MV7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Rnf17Q99MV7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rnf17Q99MV7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rnf17Q99MV7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rnf17Q99MV7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rnf17Q99MV7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rnf17Q99MV7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rnf17Q99MV7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Rnf17Q99MV7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rnf17Q99MV7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rnf17Q99MV7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Rnf17Q99MV7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rnf17Q99MV7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rnf17Q99MV7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rnf17Q99MV7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rnf17Q99MV7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rnf17Q99MV7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rnf17Q99MV7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rnf17Q99MV7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rnf17Q99MV7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rnf17Q99MV7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rnf17Q99MV7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rnf17Q99MV7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rnf17Q99MV7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC32.57■■■□□ 2.81
Rnf17Q99MV7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rnf17Q99MV7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rnf17Q99MV7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rnf17Q99MV7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rnf17Q99MV7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rnf17Q99MV7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rnf17Q99MV7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rnf17Q99MV7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rnf17Q99MV7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rnf17Q99MV7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rnf17Q99MV7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rnf17Q99MV7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rnf17Q99MV7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rnf17Q99MV7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rnf17Q99MV7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rnf17Q99MV7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rnf17Q99MV7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rnf17Q99MV7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Rnf17Q99MV7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rnf17Q99MV7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rnf17Q99MV7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rnf17Q99MV7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rnf17Q99MV7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms