Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tdrd1Q99MV1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tdrd1Q99MV1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tdrd1Q99MV1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tdrd1Q99MV1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tdrd1Q99MV1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Tdrd1Q99MV1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tdrd1Q99MV1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tdrd1Q99MV1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tdrd1Q99MV1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tdrd1Q99MV1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tdrd1Q99MV1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Tdrd1Q99MV1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tdrd1Q99MV1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tdrd1Q99MV1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tdrd1Q99MV1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tdrd1Q99MV1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tdrd1Q99MV1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tdrd1Q99MV1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tdrd1Q99MV1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tdrd1Q99MV1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tdrd1Q99MV1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tdrd1Q99MV1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tdrd1Q99MV1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tdrd1Q99MV1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Tdrd1Q99MV1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tdrd1Q99MV1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tdrd1Q99MV1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tdrd1Q99MV1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tdrd1Q99MV1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tdrd1Q99MV1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tdrd1Q99MV1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tdrd1Q99MV1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tdrd1Q99MV1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tdrd1Q99MV1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tdrd1Q99MV1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tdrd1Q99MV1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Tdrd1Q99MV1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tdrd1Q99MV1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tdrd1Q99MV1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tdrd1Q99MV1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tdrd1Q99MV1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tdrd1Q99MV1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tdrd1Q99MV1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tdrd1Q99MV1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tdrd1Q99MV1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tdrd1Q99MV1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tdrd1Q99MV1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tdrd1Q99MV1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tdrd1Q99MV1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tdrd1Q99MV1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tdrd1Q99MV1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tdrd1Q99MV1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tdrd1Q99MV1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tdrd1Q99MV1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Tdrd1Q99MV1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tdrd1Q99MV1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tdrd1Q99MV1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tdrd1Q99MV1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Tdrd1Q99MV1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tdrd1Q99MV1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tdrd1Q99MV1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tdrd1Q99MV1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tdrd1Q99MV1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tdrd1Q99MV1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tdrd1Q99MV1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tdrd1Q99MV1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tdrd1Q99MV1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tdrd1Q99MV1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tdrd1Q99MV1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Tdrd1Q99MV1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tdrd1Q99MV1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tdrd1Q99MV1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tdrd1Q99MV1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tdrd1Q99MV1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tdrd1Q99MV1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tdrd1Q99MV1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tdrd1Q99MV1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tdrd1Q99MV1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tdrd1Q99MV1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tdrd1Q99MV1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tdrd1Q99MV1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tdrd1Q99MV1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tdrd1Q99MV1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tdrd1Q99MV1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tdrd1Q99MV1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tdrd1Q99MV1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tdrd1Q99MV1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tdrd1Q99MV1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tdrd1Q99MV1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tdrd1Q99MV1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tdrd1Q99MV1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tdrd1Q99MV1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tdrd1Q99MV1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tdrd1Q99MV1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tdrd1Q99MV1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tdrd1Q99MV1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tdrd1Q99MV1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tdrd1Q99MV1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tdrd1Q99MV1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms