Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SncaipQ99ME3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SncaipQ99ME3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SncaipQ99ME3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SncaipQ99ME3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SncaipQ99ME3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SncaipQ99ME3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SncaipQ99ME3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SncaipQ99ME3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SncaipQ99ME3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SncaipQ99ME3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SncaipQ99ME3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SncaipQ99ME3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SncaipQ99ME3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SncaipQ99ME3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SncaipQ99ME3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SncaipQ99ME3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SncaipQ99ME3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SncaipQ99ME3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SncaipQ99ME3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SncaipQ99ME3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SncaipQ99ME3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SncaipQ99ME3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SncaipQ99ME3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SncaipQ99ME3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SncaipQ99ME3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SncaipQ99ME3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SncaipQ99ME3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SncaipQ99ME3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SncaipQ99ME3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SncaipQ99ME3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SncaipQ99ME3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SncaipQ99ME3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SncaipQ99ME3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SncaipQ99ME3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SncaipQ99ME3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SncaipQ99ME3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SncaipQ99ME3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SncaipQ99ME3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SncaipQ99ME3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SncaipQ99ME3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SncaipQ99ME3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SncaipQ99ME3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SncaipQ99ME3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SncaipQ99ME3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SncaipQ99ME3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SncaipQ99ME3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SncaipQ99ME3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SncaipQ99ME3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SncaipQ99ME3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SncaipQ99ME3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SncaipQ99ME3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SncaipQ99ME3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SncaipQ99ME3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SncaipQ99ME3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SncaipQ99ME3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SncaipQ99ME3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SncaipQ99ME3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SncaipQ99ME3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SncaipQ99ME3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SncaipQ99ME3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SncaipQ99ME3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SncaipQ99ME3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SncaipQ99ME3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SncaipQ99ME3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SncaipQ99ME3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SncaipQ99ME3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SncaipQ99ME3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SncaipQ99ME3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SncaipQ99ME3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SncaipQ99ME3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SncaipQ99ME3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SncaipQ99ME3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SncaipQ99ME3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SncaipQ99ME3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SncaipQ99ME3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SncaipQ99ME3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SncaipQ99ME3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SncaipQ99ME3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SncaipQ99ME3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SncaipQ99ME3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SncaipQ99ME3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SncaipQ99ME3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SncaipQ99ME3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SncaipQ99ME3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SncaipQ99ME3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SncaipQ99ME3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SncaipQ99ME3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SncaipQ99ME3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SncaipQ99ME3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SncaipQ99ME3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SncaipQ99ME3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SncaipQ99ME3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SncaipQ99ME3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SncaipQ99ME3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SncaipQ99ME3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SncaipQ99ME3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SncaipQ99ME3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SncaipQ99ME3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SncaipQ99ME3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms