Protein–RNA interactions for Protein: Q99M08

Uncharacterized protein C4orf3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99M08 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q99M08 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q99M08 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q99M08 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q99M08 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q99M08 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q99M08 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q99M08 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q99M08 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q99M08 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q99M08 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q99M08 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q99M08 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q99M08 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q99M08 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q99M08 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q99M08 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q99M08 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q99M08 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q99M08 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q99M08 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99M08 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99M08 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99M08 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99M08 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99M08 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99M08 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99M08 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99M08 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99M08 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99M08 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q99M08 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99M08 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99M08 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99M08 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99M08 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99M08 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99M08 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99M08 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99M08 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99M08 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99M08 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99M08 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99M08 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99M08 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99M08 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99M08 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99M08 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99M08 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99M08 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99M08 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99M08 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99M08 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99M08 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99M08 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99M08 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99M08 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99M08 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99M08 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99M08 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99M08 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99M08 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99M08 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99M08 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99M08 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99M08 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99M08 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99M08 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99M08 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99M08 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99M08 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99M08 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99M08 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99M08 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99M08 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99M08 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99M08 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99M08 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99M08 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99M08 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q99M08 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q99M08 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q99M08 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q99M08 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q99M08 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q99M08 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q99M08 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q99M08 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q99M08 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q99M08 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q99M08 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q99M08 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q99M08 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q99M08 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q99M08 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q99M08 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q99M08 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q99M08 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q99M08 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q99M08 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms