Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gins4Q99LZ3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gins4Q99LZ3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gins4Q99LZ3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gins4Q99LZ3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gins4Q99LZ3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gins4Q99LZ3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.1 ms