Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sh3bp5lQ99LH9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sh3bp5lQ99LH9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sh3bp5lQ99LH9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sh3bp5lQ99LH9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sh3bp5lQ99LH9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sh3bp5lQ99LH9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sh3bp5lQ99LH9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sh3bp5lQ99LH9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sh3bp5lQ99LH9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sh3bp5lQ99LH9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sh3bp5lQ99LH9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sh3bp5lQ99LH9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sh3bp5lQ99LH9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sh3bp5lQ99LH9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Sh3bp5lQ99LH9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sh3bp5lQ99LH9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sh3bp5lQ99LH9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sh3bp5lQ99LH9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sh3bp5lQ99LH9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sh3bp5lQ99LH9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sh3bp5lQ99LH9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sh3bp5lQ99LH9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sh3bp5lQ99LH9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sh3bp5lQ99LH9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sh3bp5lQ99LH9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sh3bp5lQ99LH9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sh3bp5lQ99LH9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sh3bp5lQ99LH9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sh3bp5lQ99LH9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sh3bp5lQ99LH9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sh3bp5lQ99LH9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sh3bp5lQ99LH9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sh3bp5lQ99LH9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sh3bp5lQ99LH9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sh3bp5lQ99LH9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sh3bp5lQ99LH9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sh3bp5lQ99LH9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Sh3bp5lQ99LH9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sh3bp5lQ99LH9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sh3bp5lQ99LH9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sh3bp5lQ99LH9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sh3bp5lQ99LH9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sh3bp5lQ99LH9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sh3bp5lQ99LH9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sh3bp5lQ99LH9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sh3bp5lQ99LH9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sh3bp5lQ99LH9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sh3bp5lQ99LH9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Sh3bp5lQ99LH9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Sh3bp5lQ99LH9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sh3bp5lQ99LH9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sh3bp5lQ99LH9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sh3bp5lQ99LH9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sh3bp5lQ99LH9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sh3bp5lQ99LH9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sh3bp5lQ99LH9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sh3bp5lQ99LH9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sh3bp5lQ99LH9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sh3bp5lQ99LH9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sh3bp5lQ99LH9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sh3bp5lQ99LH9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sh3bp5lQ99LH9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sh3bp5lQ99LH9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sh3bp5lQ99LH9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Sh3bp5lQ99LH9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sh3bp5lQ99LH9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sh3bp5lQ99LH9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Sh3bp5lQ99LH9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Sh3bp5lQ99LH9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sh3bp5lQ99LH9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sh3bp5lQ99LH9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Sh3bp5lQ99LH9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sh3bp5lQ99LH9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sh3bp5lQ99LH9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sh3bp5lQ99LH9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sh3bp5lQ99LH9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sh3bp5lQ99LH9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sh3bp5lQ99LH9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sh3bp5lQ99LH9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sh3bp5lQ99LH9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sh3bp5lQ99LH9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sh3bp5lQ99LH9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms