Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcf2Q99LE6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcf2Q99LE6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Abcf2Q99LE6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcf2Q99LE6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcf2Q99LE6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcf2Q99LE6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcf2Q99LE6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcf2Q99LE6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcf2Q99LE6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcf2Q99LE6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcf2Q99LE6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcf2Q99LE6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcf2Q99LE6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcf2Q99LE6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcf2Q99LE6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcf2Q99LE6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcf2Q99LE6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcf2Q99LE6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcf2Q99LE6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcf2Q99LE6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcf2Q99LE6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcf2Q99LE6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcf2Q99LE6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcf2Q99LE6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcf2Q99LE6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcf2Q99LE6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcf2Q99LE6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcf2Q99LE6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcf2Q99LE6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcf2Q99LE6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcf2Q99LE6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcf2Q99LE6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcf2Q99LE6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcf2Q99LE6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcf2Q99LE6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcf2Q99LE6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcf2Q99LE6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcf2Q99LE6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcf2Q99LE6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcf2Q99LE6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcf2Q99LE6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcf2Q99LE6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcf2Q99LE6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcf2Q99LE6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcf2Q99LE6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Abcf2Q99LE6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Abcf2Q99LE6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcf2Q99LE6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcf2Q99LE6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcf2Q99LE6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcf2Q99LE6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcf2Q99LE6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcf2Q99LE6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcf2Q99LE6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcf2Q99LE6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcf2Q99LE6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcf2Q99LE6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcf2Q99LE6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcf2Q99LE6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcf2Q99LE6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcf2Q99LE6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcf2Q99LE6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcf2Q99LE6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcf2Q99LE6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcf2Q99LE6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcf2Q99LE6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcf2Q99LE6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcf2Q99LE6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcf2Q99LE6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcf2Q99LE6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcf2Q99LE6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcf2Q99LE6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcf2Q99LE6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcf2Q99LE6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcf2Q99LE6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcf2Q99LE6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcf2Q99LE6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcf2Q99LE6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcf2Q99LE6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcf2Q99LE6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcf2Q99LE6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcf2Q99LE6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcf2Q99LE6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcf2Q99LE6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcf2Q99LE6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcf2Q99LE6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcf2Q99LE6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcf2Q99LE6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms