Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lysmd3Q99LE3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lysmd3Q99LE3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lysmd3Q99LE3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lysmd3Q99LE3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lysmd3Q99LE3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lysmd3Q99LE3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lysmd3Q99LE3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lysmd3Q99LE3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lysmd3Q99LE3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lysmd3Q99LE3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lysmd3Q99LE3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lysmd3Q99LE3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lysmd3Q99LE3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lysmd3Q99LE3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lysmd3Q99LE3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lysmd3Q99LE3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lysmd3Q99LE3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lysmd3Q99LE3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lysmd3Q99LE3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lysmd3Q99LE3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lysmd3Q99LE3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lysmd3Q99LE3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lysmd3Q99LE3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lysmd3Q99LE3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lysmd3Q99LE3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lysmd3Q99LE3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lysmd3Q99LE3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lysmd3Q99LE3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lysmd3Q99LE3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lysmd3Q99LE3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lysmd3Q99LE3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lysmd3Q99LE3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lysmd3Q99LE3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lysmd3Q99LE3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lysmd3Q99LE3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lysmd3Q99LE3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lysmd3Q99LE3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lysmd3Q99LE3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lysmd3Q99LE3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lysmd3Q99LE3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lysmd3Q99LE3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lysmd3Q99LE3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lysmd3Q99LE3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lysmd3Q99LE3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lysmd3Q99LE3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lysmd3Q99LE3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lysmd3Q99LE3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lysmd3Q99LE3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lysmd3Q99LE3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lysmd3Q99LE3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lysmd3Q99LE3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lysmd3Q99LE3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lysmd3Q99LE3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Lysmd3Q99LE3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lysmd3Q99LE3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lysmd3Q99LE3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lysmd3Q99LE3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lysmd3Q99LE3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lysmd3Q99LE3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lysmd3Q99LE3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lysmd3Q99LE3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lysmd3Q99LE3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lysmd3Q99LE3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lysmd3Q99LE3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lysmd3Q99LE3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lysmd3Q99LE3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lysmd3Q99LE3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lysmd3Q99LE3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lysmd3Q99LE3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lysmd3Q99LE3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lysmd3Q99LE3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lysmd3Q99LE3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lysmd3Q99LE3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lysmd3Q99LE3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lysmd3Q99LE3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lysmd3Q99LE3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lysmd3Q99LE3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lysmd3Q99LE3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lysmd3Q99LE3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lysmd3Q99LE3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lysmd3Q99LE3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lysmd3Q99LE3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lysmd3Q99LE3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lysmd3Q99LE3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lysmd3Q99LE3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lysmd3Q99LE3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lysmd3Q99LE3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lysmd3Q99LE3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lysmd3Q99LE3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lysmd3Q99LE3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lysmd3Q99LE3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lysmd3Q99LE3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lysmd3Q99LE3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lysmd3Q99LE3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lysmd3Q99LE3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lysmd3Q99LE3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lysmd3Q99LE3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lysmd3Q99LE3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lysmd3Q99LE3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms