Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TriobpQ99KW3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TriobpQ99KW3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TriobpQ99KW3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TriobpQ99KW3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TriobpQ99KW3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TriobpQ99KW3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TriobpQ99KW3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TriobpQ99KW3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TriobpQ99KW3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TriobpQ99KW3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TriobpQ99KW3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TriobpQ99KW3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TriobpQ99KW3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TriobpQ99KW3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TriobpQ99KW3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TriobpQ99KW3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TriobpQ99KW3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TriobpQ99KW3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TriobpQ99KW3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TriobpQ99KW3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TriobpQ99KW3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TriobpQ99KW3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TriobpQ99KW3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TriobpQ99KW3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TriobpQ99KW3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TriobpQ99KW3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TriobpQ99KW3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TriobpQ99KW3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TriobpQ99KW3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TriobpQ99KW3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TriobpQ99KW3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TriobpQ99KW3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TriobpQ99KW3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TriobpQ99KW3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TriobpQ99KW3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TriobpQ99KW3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TriobpQ99KW3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TriobpQ99KW3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TriobpQ99KW3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TriobpQ99KW3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TriobpQ99KW3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TriobpQ99KW3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TriobpQ99KW3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TriobpQ99KW3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TriobpQ99KW3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TriobpQ99KW3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TriobpQ99KW3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TriobpQ99KW3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TriobpQ99KW3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TriobpQ99KW3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TriobpQ99KW3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TriobpQ99KW3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TriobpQ99KW3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TriobpQ99KW3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TriobpQ99KW3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TriobpQ99KW3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TriobpQ99KW3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TriobpQ99KW3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TriobpQ99KW3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TriobpQ99KW3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TriobpQ99KW3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TriobpQ99KW3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TriobpQ99KW3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TriobpQ99KW3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TriobpQ99KW3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TriobpQ99KW3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TriobpQ99KW3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TriobpQ99KW3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TriobpQ99KW3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TriobpQ99KW3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TriobpQ99KW3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TriobpQ99KW3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TriobpQ99KW3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TriobpQ99KW3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TriobpQ99KW3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TriobpQ99KW3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TriobpQ99KW3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TriobpQ99KW3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TriobpQ99KW3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TriobpQ99KW3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TriobpQ99KW3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TriobpQ99KW3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TriobpQ99KW3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TriobpQ99KW3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TriobpQ99KW3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TriobpQ99KW3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TriobpQ99KW3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TriobpQ99KW3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TriobpQ99KW3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TriobpQ99KW3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TriobpQ99KW3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TriobpQ99KW3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TriobpQ99KW3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TriobpQ99KW3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TriobpQ99KW3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TriobpQ99KW3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TriobpQ99KW3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TriobpQ99KW3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TriobpQ99KW3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms