Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW1

Abhd17a, Protein ABHD17A, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abhd17aQ99JW1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Abhd17aQ99JW1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abhd17aQ99JW1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abhd17aQ99JW1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abhd17aQ99JW1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abhd17aQ99JW1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abhd17aQ99JW1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abhd17aQ99JW1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abhd17aQ99JW1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abhd17aQ99JW1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abhd17aQ99JW1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abhd17aQ99JW1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abhd17aQ99JW1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abhd17aQ99JW1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abhd17aQ99JW1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abhd17aQ99JW1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abhd17aQ99JW1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Abhd17aQ99JW1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abhd17aQ99JW1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abhd17aQ99JW1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abhd17aQ99JW1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abhd17aQ99JW1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abhd17aQ99JW1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abhd17aQ99JW1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abhd17aQ99JW1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abhd17aQ99JW1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abhd17aQ99JW1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Abhd17aQ99JW1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abhd17aQ99JW1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abhd17aQ99JW1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abhd17aQ99JW1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Abhd17aQ99JW1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Abhd17aQ99JW1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abhd17aQ99JW1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abhd17aQ99JW1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abhd17aQ99JW1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abhd17aQ99JW1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Abhd17aQ99JW1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abhd17aQ99JW1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Abhd17aQ99JW1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abhd17aQ99JW1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abhd17aQ99JW1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Abhd17aQ99JW1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abhd17aQ99JW1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abhd17aQ99JW1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abhd17aQ99JW1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abhd17aQ99JW1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abhd17aQ99JW1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abhd17aQ99JW1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abhd17aQ99JW1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abhd17aQ99JW1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abhd17aQ99JW1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abhd17aQ99JW1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Abhd17aQ99JW1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms