Protein–RNA interactions for Protein: Q924T3

Xrcc4, DNA repair protein XRCC4, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc4Q924T3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Xrcc4Q924T3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Xrcc4Q924T3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Xrcc4Q924T3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Xrcc4Q924T3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Xrcc4Q924T3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Xrcc4Q924T3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Xrcc4Q924T3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Xrcc4Q924T3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Xrcc4Q924T3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Xrcc4Q924T3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Xrcc4Q924T3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Xrcc4Q924T3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Xrcc4Q924T3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Xrcc4Q924T3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Xrcc4Q924T3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Xrcc4Q924T3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Xrcc4Q924T3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Xrcc4Q924T3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Xrcc4Q924T3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Xrcc4Q924T3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Xrcc4Q924T3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Xrcc4Q924T3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Xrcc4Q924T3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Xrcc4Q924T3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Xrcc4Q924T3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Xrcc4Q924T3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Xrcc4Q924T3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Xrcc4Q924T3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Xrcc4Q924T3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Xrcc4Q924T3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Xrcc4Q924T3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Xrcc4Q924T3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Xrcc4Q924T3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Xrcc4Q924T3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Xrcc4Q924T3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Xrcc4Q924T3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Xrcc4Q924T3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Xrcc4Q924T3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Xrcc4Q924T3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Xrcc4Q924T3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Xrcc4Q924T3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Xrcc4Q924T3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Xrcc4Q924T3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Xrcc4Q924T3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Xrcc4Q924T3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Xrcc4Q924T3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Xrcc4Q924T3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Xrcc4Q924T3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Xrcc4Q924T3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Xrcc4Q924T3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Xrcc4Q924T3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Xrcc4Q924T3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Xrcc4Q924T3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Xrcc4Q924T3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Xrcc4Q924T3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Xrcc4Q924T3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Xrcc4Q924T3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Xrcc4Q924T3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Xrcc4Q924T3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Xrcc4Q924T3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Xrcc4Q924T3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Xrcc4Q924T3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Xrcc4Q924T3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Xrcc4Q924T3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Xrcc4Q924T3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Xrcc4Q924T3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Xrcc4Q924T3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Xrcc4Q924T3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Xrcc4Q924T3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Xrcc4Q924T3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Xrcc4Q924T3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Xrcc4Q924T3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Xrcc4Q924T3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Xrcc4Q924T3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Xrcc4Q924T3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Xrcc4Q924T3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Xrcc4Q924T3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Xrcc4Q924T3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Xrcc4Q924T3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Xrcc4Q924T3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Xrcc4Q924T3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Xrcc4Q924T3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Xrcc4Q924T3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Xrcc4Q924T3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Xrcc4Q924T3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Xrcc4Q924T3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Xrcc4Q924T3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Xrcc4Q924T3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Xrcc4Q924T3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Xrcc4Q924T3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Xrcc4Q924T3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Xrcc4Q924T3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Xrcc4Q924T3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Xrcc4Q924T3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Xrcc4Q924T3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Xrcc4Q924T3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Xrcc4Q924T3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Xrcc4Q924T3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Xrcc4Q924T3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms