Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Clip1Q922J3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Clip1Q922J3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Clip1Q922J3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Clip1Q922J3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Clip1Q922J3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Clip1Q922J3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Clip1Q922J3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Clip1Q922J3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Clip1Q922J3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Clip1Q922J3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Clip1Q922J3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Clip1Q922J3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Clip1Q922J3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Clip1Q922J3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Clip1Q922J3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Clip1Q922J3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Clip1Q922J3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Clip1Q922J3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Clip1Q922J3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Clip1Q922J3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Clip1Q922J3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Clip1Q922J3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Clip1Q922J3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Clip1Q922J3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Clip1Q922J3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Clip1Q922J3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Clip1Q922J3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Clip1Q922J3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Clip1Q922J3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Clip1Q922J3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Clip1Q922J3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Clip1Q922J3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Clip1Q922J3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Clip1Q922J3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Clip1Q922J3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Clip1Q922J3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Clip1Q922J3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Clip1Q922J3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Clip1Q922J3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Clip1Q922J3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Clip1Q922J3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Clip1Q922J3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Clip1Q922J3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Clip1Q922J3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Clip1Q922J3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Clip1Q922J3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Clip1Q922J3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Clip1Q922J3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Clip1Q922J3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Clip1Q922J3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Clip1Q922J3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Clip1Q922J3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Clip1Q922J3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Clip1Q922J3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Clip1Q922J3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Clip1Q922J3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Clip1Q922J3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Clip1Q922J3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Clip1Q922J3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Clip1Q922J3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Clip1Q922J3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Clip1Q922J3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Clip1Q922J3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Clip1Q922J3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Clip1Q922J3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Clip1Q922J3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Clip1Q922J3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Clip1Q922J3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Clip1Q922J3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Clip1Q922J3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Clip1Q922J3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Clip1Q922J3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Clip1Q922J3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Clip1Q922J3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Clip1Q922J3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Clip1Q922J3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Clip1Q922J3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Clip1Q922J3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Clip1Q922J3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Clip1Q922J3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Clip1Q922J3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Clip1Q922J3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Clip1Q922J3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Clip1Q922J3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Clip1Q922J3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Clip1Q922J3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Clip1Q922J3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Clip1Q922J3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Clip1Q922J3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Clip1Q922J3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Clip1Q922J3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Clip1Q922J3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Clip1Q922J3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Clip1Q922J3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Clip1Q922J3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Clip1Q922J3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Clip1Q922J3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Clip1Q922J3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Clip1Q922J3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.9 ms