Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nek8Q91ZR4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nek8Q91ZR4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nek8Q91ZR4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nek8Q91ZR4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nek8Q91ZR4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek8Q91ZR4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek8Q91ZR4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek8Q91ZR4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek8Q91ZR4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek8Q91ZR4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek8Q91ZR4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek8Q91ZR4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek8Q91ZR4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek8Q91ZR4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek8Q91ZR4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek8Q91ZR4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek8Q91ZR4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek8Q91ZR4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek8Q91ZR4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek8Q91ZR4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek8Q91ZR4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek8Q91ZR4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek8Q91ZR4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek8Q91ZR4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek8Q91ZR4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek8Q91ZR4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek8Q91ZR4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek8Q91ZR4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek8Q91ZR4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek8Q91ZR4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek8Q91ZR4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek8Q91ZR4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek8Q91ZR4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek8Q91ZR4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek8Q91ZR4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek8Q91ZR4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek8Q91ZR4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek8Q91ZR4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek8Q91ZR4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nek8Q91ZR4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nek8Q91ZR4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nek8Q91ZR4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nek8Q91ZR4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nek8Q91ZR4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nek8Q91ZR4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nek8Q91ZR4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nek8Q91ZR4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nek8Q91ZR4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nek8Q91ZR4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek8Q91ZR4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek8Q91ZR4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek8Q91ZR4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek8Q91ZR4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek8Q91ZR4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek8Q91ZR4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek8Q91ZR4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek8Q91ZR4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek8Q91ZR4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek8Q91ZR4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek8Q91ZR4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek8Q91ZR4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek8Q91ZR4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek8Q91ZR4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek8Q91ZR4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek8Q91ZR4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek8Q91ZR4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek8Q91ZR4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek8Q91ZR4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek8Q91ZR4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek8Q91ZR4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek8Q91ZR4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek8Q91ZR4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek8Q91ZR4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek8Q91ZR4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek8Q91ZR4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek8Q91ZR4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek8Q91ZR4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nek8Q91ZR4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nek8Q91ZR4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nek8Q91ZR4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek8Q91ZR4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek8Q91ZR4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek8Q91ZR4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek8Q91ZR4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek8Q91ZR4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek8Q91ZR4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek8Q91ZR4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek8Q91ZR4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek8Q91ZR4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek8Q91ZR4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek8Q91ZR4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek8Q91ZR4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek8Q91ZR4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek8Q91ZR4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek8Q91ZR4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek8Q91ZR4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek8Q91ZR4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek8Q91ZR4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek8Q91ZR4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms