Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y18

Pcdha12, Protocadherin alpha 12, mousemouse

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha12Q91Y18 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcdha12Q91Y18 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcdha12Q91Y18 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcdha12Q91Y18 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcdha12Q91Y18 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcdha12Q91Y18 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcdha12Q91Y18 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcdha12Q91Y18 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcdha12Q91Y18 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcdha12Q91Y18 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcdha12Q91Y18 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcdha12Q91Y18 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcdha12Q91Y18 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcdha12Q91Y18 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcdha12Q91Y18 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcdha12Q91Y18 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcdha12Q91Y18 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcdha12Q91Y18 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcdha12Q91Y18 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcdha12Q91Y18 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcdha12Q91Y18 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcdha12Q91Y18 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcdha12Q91Y18 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcdha12Q91Y18 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcdha12Q91Y18 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcdha12Q91Y18 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcdha12Q91Y18 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcdha12Q91Y18 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcdha12Q91Y18 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcdha12Q91Y18 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcdha12Q91Y18 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcdha12Q91Y18 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcdha12Q91Y18 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcdha12Q91Y18 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcdha12Q91Y18 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcdha12Q91Y18 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcdha12Q91Y18 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcdha12Q91Y18 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcdha12Q91Y18 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcdha12Q91Y18 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcdha12Q91Y18 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcdha12Q91Y18 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcdha12Q91Y18 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcdha12Q91Y18 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcdha12Q91Y18 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pcdha12Q91Y18 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pcdha12Q91Y18 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcdha12Q91Y18 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcdha12Q91Y18 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcdha12Q91Y18 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcdha12Q91Y18 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdha12Q91Y18 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdha12Q91Y18 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdha12Q91Y18 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdha12Q91Y18 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdha12Q91Y18 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdha12Q91Y18 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdha12Q91Y18 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdha12Q91Y18 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcdha12Q91Y18 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcdha12Q91Y18 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdha12Q91Y18 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdha12Q91Y18 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdha12Q91Y18 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdha12Q91Y18 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdha12Q91Y18 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdha12Q91Y18 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdha12Q91Y18 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdha12Q91Y18 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdha12Q91Y18 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdha12Q91Y18 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdha12Q91Y18 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdha12Q91Y18 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdha12Q91Y18 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdha12Q91Y18 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdha12Q91Y18 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdha12Q91Y18 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdha12Q91Y18 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdha12Q91Y18 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdha12Q91Y18 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdha12Q91Y18 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdha12Q91Y18 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdha12Q91Y18 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdha12Q91Y18 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdha12Q91Y18 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdha12Q91Y18 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdha12Q91Y18 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdha12Q91Y18 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdha12Q91Y18 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdha12Q91Y18 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdha12Q91Y18 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdha12Q91Y18 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdha12Q91Y18 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdha12Q91Y18 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdha12Q91Y18 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdha12Q91Y18 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdha12Q91Y18 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdha12Q91Y18 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdha12Q91Y18 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdha12Q91Y18 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms