Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y16

Pcdha3, Protocadherin alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha3Q91Y16 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdha3Q91Y16 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdha3Q91Y16 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdha3Q91Y16 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdha3Q91Y16 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdha3Q91Y16 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdha3Q91Y16 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdha3Q91Y16 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdha3Q91Y16 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdha3Q91Y16 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha3Q91Y16 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha3Q91Y16 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha3Q91Y16 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha3Q91Y16 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha3Q91Y16 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha3Q91Y16 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha3Q91Y16 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha3Q91Y16 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha3Q91Y16 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha3Q91Y16 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha3Q91Y16 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha3Q91Y16 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha3Q91Y16 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha3Q91Y16 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha3Q91Y16 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha3Q91Y16 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha3Q91Y16 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha3Q91Y16 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha3Q91Y16 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha3Q91Y16 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdha3Q91Y16 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdha3Q91Y16 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdha3Q91Y16 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdha3Q91Y16 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdha3Q91Y16 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdha3Q91Y16 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdha3Q91Y16 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdha3Q91Y16 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcdha3Q91Y16 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcdha3Q91Y16 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcdha3Q91Y16 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdha3Q91Y16 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdha3Q91Y16 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdha3Q91Y16 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdha3Q91Y16 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha3Q91Y16 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha3Q91Y16 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha3Q91Y16 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha3Q91Y16 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha3Q91Y16 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha3Q91Y16 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha3Q91Y16 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha3Q91Y16 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha3Q91Y16 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha3Q91Y16 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha3Q91Y16 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha3Q91Y16 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha3Q91Y16 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha3Q91Y16 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha3Q91Y16 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdha3Q91Y16 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdha3Q91Y16 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdha3Q91Y16 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdha3Q91Y16 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdha3Q91Y16 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdha3Q91Y16 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha3Q91Y16 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha3Q91Y16 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha3Q91Y16 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha3Q91Y16 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha3Q91Y16 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha3Q91Y16 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha3Q91Y16 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha3Q91Y16 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha3Q91Y16 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha3Q91Y16 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha3Q91Y16 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdha3Q91Y16 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdha3Q91Y16 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdha3Q91Y16 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdha3Q91Y16 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdha3Q91Y16 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcdha3Q91Y16 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcdha3Q91Y16 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcdha3Q91Y16 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcdha3Q91Y16 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha3Q91Y16 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha3Q91Y16 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha3Q91Y16 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha3Q91Y16 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha3Q91Y16 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha3Q91Y16 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha3Q91Y16 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha3Q91Y16 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha3Q91Y16 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha3Q91Y16 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha3Q91Y16 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha3Q91Y16 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha3Q91Y16 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha3Q91Y16 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms