Protein–RNA interactions for Protein: Q91WU4

Tmco4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco4Q91WU4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmco4Q91WU4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmco4Q91WU4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmco4Q91WU4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmco4Q91WU4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmco4Q91WU4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmco4Q91WU4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmco4Q91WU4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmco4Q91WU4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmco4Q91WU4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmco4Q91WU4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmco4Q91WU4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmco4Q91WU4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmco4Q91WU4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmco4Q91WU4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmco4Q91WU4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmco4Q91WU4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmco4Q91WU4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmco4Q91WU4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmco4Q91WU4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmco4Q91WU4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmco4Q91WU4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmco4Q91WU4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmco4Q91WU4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmco4Q91WU4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmco4Q91WU4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmco4Q91WU4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmco4Q91WU4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmco4Q91WU4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmco4Q91WU4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmco4Q91WU4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmco4Q91WU4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmco4Q91WU4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmco4Q91WU4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmco4Q91WU4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tmco4Q91WU4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tmco4Q91WU4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmco4Q91WU4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmco4Q91WU4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmco4Q91WU4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmco4Q91WU4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmco4Q91WU4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmco4Q91WU4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmco4Q91WU4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmco4Q91WU4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmco4Q91WU4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmco4Q91WU4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmco4Q91WU4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmco4Q91WU4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmco4Q91WU4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmco4Q91WU4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmco4Q91WU4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmco4Q91WU4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmco4Q91WU4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmco4Q91WU4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmco4Q91WU4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmco4Q91WU4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmco4Q91WU4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmco4Q91WU4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmco4Q91WU4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmco4Q91WU4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmco4Q91WU4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmco4Q91WU4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmco4Q91WU4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmco4Q91WU4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmco4Q91WU4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmco4Q91WU4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmco4Q91WU4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmco4Q91WU4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmco4Q91WU4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tmco4Q91WU4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmco4Q91WU4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmco4Q91WU4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmco4Q91WU4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmco4Q91WU4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmco4Q91WU4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmco4Q91WU4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmco4Q91WU4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmco4Q91WU4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmco4Q91WU4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmco4Q91WU4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmco4Q91WU4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmco4Q91WU4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmco4Q91WU4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmco4Q91WU4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmco4Q91WU4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmco4Q91WU4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmco4Q91WU4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmco4Q91WU4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmco4Q91WU4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmco4Q91WU4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmco4Q91WU4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmco4Q91WU4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmco4Q91WU4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmco4Q91WU4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmco4Q91WU4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmco4Q91WU4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmco4Q91WU4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmco4Q91WU4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmco4Q91WU4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms