Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHI7

Ccdc65, Coiled-coil domain-containing protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc65Q8VHI7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc65Q8VHI7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc65Q8VHI7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc65Q8VHI7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc65Q8VHI7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc65Q8VHI7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc65Q8VHI7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc65Q8VHI7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc65Q8VHI7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc65Q8VHI7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc65Q8VHI7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc65Q8VHI7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc65Q8VHI7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc65Q8VHI7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc65Q8VHI7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc65Q8VHI7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc65Q8VHI7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc65Q8VHI7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc65Q8VHI7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc65Q8VHI7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc65Q8VHI7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc65Q8VHI7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc65Q8VHI7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc65Q8VHI7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc65Q8VHI7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc65Q8VHI7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc65Q8VHI7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc65Q8VHI7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc65Q8VHI7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc65Q8VHI7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc65Q8VHI7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc65Q8VHI7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc65Q8VHI7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc65Q8VHI7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc65Q8VHI7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc65Q8VHI7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc65Q8VHI7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc65Q8VHI7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc65Q8VHI7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc65Q8VHI7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc65Q8VHI7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc65Q8VHI7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc65Q8VHI7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc65Q8VHI7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc65Q8VHI7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc65Q8VHI7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc65Q8VHI7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc65Q8VHI7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc65Q8VHI7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc65Q8VHI7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc65Q8VHI7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc65Q8VHI7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc65Q8VHI7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc65Q8VHI7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc65Q8VHI7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc65Q8VHI7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc65Q8VHI7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc65Q8VHI7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc65Q8VHI7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc65Q8VHI7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc65Q8VHI7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc65Q8VHI7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc65Q8VHI7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc65Q8VHI7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc65Q8VHI7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc65Q8VHI7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc65Q8VHI7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc65Q8VHI7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc65Q8VHI7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc65Q8VHI7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc65Q8VHI7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc65Q8VHI7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc65Q8VHI7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc65Q8VHI7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc65Q8VHI7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc65Q8VHI7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc65Q8VHI7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc65Q8VHI7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc65Q8VHI7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc65Q8VHI7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc65Q8VHI7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc65Q8VHI7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc65Q8VHI7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc65Q8VHI7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc65Q8VHI7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc65Q8VHI7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc65Q8VHI7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc65Q8VHI7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc65Q8VHI7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc65Q8VHI7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc65Q8VHI7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc65Q8VHI7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc65Q8VHI7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc65Q8VHI7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc65Q8VHI7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc65Q8VHI7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc65Q8VHI7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc65Q8VHI7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc65Q8VHI7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc65Q8VHI7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms