Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SelenomQ8VHC3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SelenomQ8VHC3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SelenomQ8VHC3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SelenomQ8VHC3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SelenomQ8VHC3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SelenomQ8VHC3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SelenomQ8VHC3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SelenomQ8VHC3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SelenomQ8VHC3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SelenomQ8VHC3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SelenomQ8VHC3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SelenomQ8VHC3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SelenomQ8VHC3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SelenomQ8VHC3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SelenomQ8VHC3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SelenomQ8VHC3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SelenomQ8VHC3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SelenomQ8VHC3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SelenomQ8VHC3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SelenomQ8VHC3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SelenomQ8VHC3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SelenomQ8VHC3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SelenomQ8VHC3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SelenomQ8VHC3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SelenomQ8VHC3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SelenomQ8VHC3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SelenomQ8VHC3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SelenomQ8VHC3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SelenomQ8VHC3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SelenomQ8VHC3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SelenomQ8VHC3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SelenomQ8VHC3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SelenomQ8VHC3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SelenomQ8VHC3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SelenomQ8VHC3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SelenomQ8VHC3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SelenomQ8VHC3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SelenomQ8VHC3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SelenomQ8VHC3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SelenomQ8VHC3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SelenomQ8VHC3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SelenomQ8VHC3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SelenomQ8VHC3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SelenomQ8VHC3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SelenomQ8VHC3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SelenomQ8VHC3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SelenomQ8VHC3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SelenomQ8VHC3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SelenomQ8VHC3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SelenomQ8VHC3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SelenomQ8VHC3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SelenomQ8VHC3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SelenomQ8VHC3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SelenomQ8VHC3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SelenomQ8VHC3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SelenomQ8VHC3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SelenomQ8VHC3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SelenomQ8VHC3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SelenomQ8VHC3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SelenomQ8VHC3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SelenomQ8VHC3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SelenomQ8VHC3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SelenomQ8VHC3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SelenomQ8VHC3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SelenomQ8VHC3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SelenomQ8VHC3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SelenomQ8VHC3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SelenomQ8VHC3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SelenomQ8VHC3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SelenomQ8VHC3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SelenomQ8VHC3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SelenomQ8VHC3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SelenomQ8VHC3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SelenomQ8VHC3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SelenomQ8VHC3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SelenomQ8VHC3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SelenomQ8VHC3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SelenomQ8VHC3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SelenomQ8VHC3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SelenomQ8VHC3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SelenomQ8VHC3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SelenomQ8VHC3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SelenomQ8VHC3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SelenomQ8VHC3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SelenomQ8VHC3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SelenomQ8VHC3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SelenomQ8VHC3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SelenomQ8VHC3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SelenomQ8VHC3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SelenomQ8VHC3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SelenomQ8VHC3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SelenomQ8VHC3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SelenomQ8VHC3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SelenomQ8VHC3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SelenomQ8VHC3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SelenomQ8VHC3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SelenomQ8VHC3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SelenomQ8VHC3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SelenomQ8VHC3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms