Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEF1

Gramd1a, GRAM domain-containing protein 1A, mousemouse

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Length 722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd1aQ8VEF1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gramd1aQ8VEF1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gramd1aQ8VEF1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gramd1aQ8VEF1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gramd1aQ8VEF1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gramd1aQ8VEF1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gramd1aQ8VEF1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gramd1aQ8VEF1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gramd1aQ8VEF1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gramd1aQ8VEF1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gramd1aQ8VEF1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gramd1aQ8VEF1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gramd1aQ8VEF1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gramd1aQ8VEF1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gramd1aQ8VEF1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gramd1aQ8VEF1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gramd1aQ8VEF1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gramd1aQ8VEF1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gramd1aQ8VEF1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gramd1aQ8VEF1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gramd1aQ8VEF1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gramd1aQ8VEF1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gramd1aQ8VEF1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gramd1aQ8VEF1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gramd1aQ8VEF1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gramd1aQ8VEF1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gramd1aQ8VEF1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gramd1aQ8VEF1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gramd1aQ8VEF1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gramd1aQ8VEF1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gramd1aQ8VEF1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gramd1aQ8VEF1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gramd1aQ8VEF1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gramd1aQ8VEF1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gramd1aQ8VEF1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gramd1aQ8VEF1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gramd1aQ8VEF1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gramd1aQ8VEF1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gramd1aQ8VEF1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gramd1aQ8VEF1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gramd1aQ8VEF1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gramd1aQ8VEF1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gramd1aQ8VEF1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gramd1aQ8VEF1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gramd1aQ8VEF1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gramd1aQ8VEF1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gramd1aQ8VEF1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gramd1aQ8VEF1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gramd1aQ8VEF1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gramd1aQ8VEF1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gramd1aQ8VEF1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gramd1aQ8VEF1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gramd1aQ8VEF1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gramd1aQ8VEF1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gramd1aQ8VEF1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gramd1aQ8VEF1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gramd1aQ8VEF1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gramd1aQ8VEF1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gramd1aQ8VEF1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gramd1aQ8VEF1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gramd1aQ8VEF1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gramd1aQ8VEF1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gramd1aQ8VEF1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gramd1aQ8VEF1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gramd1aQ8VEF1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gramd1aQ8VEF1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gramd1aQ8VEF1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gramd1aQ8VEF1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gramd1aQ8VEF1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gramd1aQ8VEF1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gramd1aQ8VEF1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gramd1aQ8VEF1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gramd1aQ8VEF1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gramd1aQ8VEF1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gramd1aQ8VEF1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gramd1aQ8VEF1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gramd1aQ8VEF1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gramd1aQ8VEF1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gramd1aQ8VEF1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gramd1aQ8VEF1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gramd1aQ8VEF1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gramd1aQ8VEF1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gramd1aQ8VEF1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gramd1aQ8VEF1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gramd1aQ8VEF1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gramd1aQ8VEF1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gramd1aQ8VEF1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gramd1aQ8VEF1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gramd1aQ8VEF1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gramd1aQ8VEF1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gramd1aQ8VEF1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gramd1aQ8VEF1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gramd1aQ8VEF1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gramd1aQ8VEF1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gramd1aQ8VEF1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gramd1aQ8VEF1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gramd1aQ8VEF1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gramd1aQ8VEF1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gramd1aQ8VEF1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gramd1aQ8VEF1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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