Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDG3

Parn, Poly(A)-specific ribonuclease PARN, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParnQ8VDG3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ParnQ8VDG3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ParnQ8VDG3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ParnQ8VDG3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ParnQ8VDG3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ParnQ8VDG3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ParnQ8VDG3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ParnQ8VDG3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ParnQ8VDG3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ParnQ8VDG3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ParnQ8VDG3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ParnQ8VDG3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ParnQ8VDG3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ParnQ8VDG3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ParnQ8VDG3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ParnQ8VDG3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ParnQ8VDG3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ParnQ8VDG3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ParnQ8VDG3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ParnQ8VDG3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ParnQ8VDG3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ParnQ8VDG3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ParnQ8VDG3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ParnQ8VDG3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ParnQ8VDG3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ParnQ8VDG3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ParnQ8VDG3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ParnQ8VDG3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ParnQ8VDG3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ParnQ8VDG3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
ParnQ8VDG3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ParnQ8VDG3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ParnQ8VDG3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ParnQ8VDG3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ParnQ8VDG3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ParnQ8VDG3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ParnQ8VDG3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ParnQ8VDG3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ParnQ8VDG3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ParnQ8VDG3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ParnQ8VDG3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ParnQ8VDG3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ParnQ8VDG3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ParnQ8VDG3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ParnQ8VDG3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ParnQ8VDG3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ParnQ8VDG3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ParnQ8VDG3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ParnQ8VDG3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ParnQ8VDG3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ParnQ8VDG3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ParnQ8VDG3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ParnQ8VDG3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ParnQ8VDG3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ParnQ8VDG3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ParnQ8VDG3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ParnQ8VDG3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ParnQ8VDG3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ParnQ8VDG3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ParnQ8VDG3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ParnQ8VDG3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ParnQ8VDG3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ParnQ8VDG3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ParnQ8VDG3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ParnQ8VDG3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ParnQ8VDG3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ParnQ8VDG3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ParnQ8VDG3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ParnQ8VDG3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ParnQ8VDG3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ParnQ8VDG3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ParnQ8VDG3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ParnQ8VDG3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ParnQ8VDG3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ParnQ8VDG3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ParnQ8VDG3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ParnQ8VDG3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ParnQ8VDG3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ParnQ8VDG3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ParnQ8VDG3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ParnQ8VDG3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ParnQ8VDG3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ParnQ8VDG3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ParnQ8VDG3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ParnQ8VDG3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ParnQ8VDG3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ParnQ8VDG3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ParnQ8VDG3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ParnQ8VDG3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ParnQ8VDG3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ParnQ8VDG3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ParnQ8VDG3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ParnQ8VDG3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ParnQ8VDG3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ParnQ8VDG3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ParnQ8VDG3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ParnQ8VDG3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ParnQ8VDG3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ParnQ8VDG3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ParnQ8VDG3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms