Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Med17Q8VCD5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Med17Q8VCD5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Med17Q8VCD5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Med17Q8VCD5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Med17Q8VCD5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Med17Q8VCD5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Med17Q8VCD5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Med17Q8VCD5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Med17Q8VCD5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Med17Q8VCD5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Med17Q8VCD5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Med17Q8VCD5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Med17Q8VCD5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Med17Q8VCD5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Med17Q8VCD5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Med17Q8VCD5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Med17Q8VCD5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Med17Q8VCD5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Med17Q8VCD5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Med17Q8VCD5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Med17Q8VCD5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Med17Q8VCD5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Med17Q8VCD5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Med17Q8VCD5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Med17Q8VCD5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Med17Q8VCD5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Med17Q8VCD5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Med17Q8VCD5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Med17Q8VCD5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Med17Q8VCD5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Med17Q8VCD5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Med17Q8VCD5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Med17Q8VCD5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Med17Q8VCD5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Med17Q8VCD5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Med17Q8VCD5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Med17Q8VCD5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Med17Q8VCD5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Med17Q8VCD5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Med17Q8VCD5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Med17Q8VCD5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Med17Q8VCD5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Med17Q8VCD5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Med17Q8VCD5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Med17Q8VCD5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Med17Q8VCD5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Med17Q8VCD5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Med17Q8VCD5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Med17Q8VCD5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Med17Q8VCD5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Med17Q8VCD5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Med17Q8VCD5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Med17Q8VCD5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Med17Q8VCD5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Med17Q8VCD5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Med17Q8VCD5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Med17Q8VCD5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Med17Q8VCD5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Med17Q8VCD5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Med17Q8VCD5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Med17Q8VCD5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Med17Q8VCD5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Med17Q8VCD5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Med17Q8VCD5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med17Q8VCD5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med17Q8VCD5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med17Q8VCD5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Med17Q8VCD5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Med17Q8VCD5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Med17Q8VCD5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Med17Q8VCD5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Med17Q8VCD5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Med17Q8VCD5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Med17Q8VCD5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Med17Q8VCD5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Med17Q8VCD5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Med17Q8VCD5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Med17Q8VCD5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med17Q8VCD5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med17Q8VCD5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med17Q8VCD5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med17Q8VCD5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med17Q8VCD5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Med17Q8VCD5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med17Q8VCD5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med17Q8VCD5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Med17Q8VCD5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Med17Q8VCD5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Med17Q8VCD5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Med17Q8VCD5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Med17Q8VCD5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Med17Q8VCD5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Med17Q8VCD5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Med17Q8VCD5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Med17Q8VCD5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Med17Q8VCD5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Med17Q8VCD5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Med17Q8VCD5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Med17Q8VCD5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms