Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ApobrQ8VBT6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ApobrQ8VBT6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ApobrQ8VBT6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ApobrQ8VBT6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ApobrQ8VBT6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ApobrQ8VBT6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ApobrQ8VBT6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ApobrQ8VBT6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ApobrQ8VBT6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ApobrQ8VBT6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ApobrQ8VBT6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ApobrQ8VBT6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ApobrQ8VBT6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ApobrQ8VBT6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ApobrQ8VBT6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ApobrQ8VBT6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ApobrQ8VBT6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ApobrQ8VBT6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ApobrQ8VBT6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ApobrQ8VBT6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ApobrQ8VBT6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ApobrQ8VBT6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ApobrQ8VBT6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ApobrQ8VBT6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ApobrQ8VBT6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ApobrQ8VBT6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ApobrQ8VBT6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ApobrQ8VBT6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ApobrQ8VBT6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ApobrQ8VBT6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ApobrQ8VBT6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ApobrQ8VBT6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ApobrQ8VBT6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ApobrQ8VBT6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ApobrQ8VBT6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ApobrQ8VBT6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ApobrQ8VBT6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ApobrQ8VBT6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ApobrQ8VBT6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ApobrQ8VBT6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ApobrQ8VBT6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ApobrQ8VBT6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ApobrQ8VBT6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ApobrQ8VBT6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ApobrQ8VBT6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ApobrQ8VBT6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ApobrQ8VBT6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ApobrQ8VBT6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ApobrQ8VBT6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ApobrQ8VBT6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ApobrQ8VBT6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ApobrQ8VBT6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ApobrQ8VBT6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ApobrQ8VBT6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ApobrQ8VBT6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ApobrQ8VBT6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ApobrQ8VBT6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
ApobrQ8VBT6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ApobrQ8VBT6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ApobrQ8VBT6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ApobrQ8VBT6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ApobrQ8VBT6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ApobrQ8VBT6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ApobrQ8VBT6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ApobrQ8VBT6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ApobrQ8VBT6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ApobrQ8VBT6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ApobrQ8VBT6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ApobrQ8VBT6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ApobrQ8VBT6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ApobrQ8VBT6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
ApobrQ8VBT6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ApobrQ8VBT6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ApobrQ8VBT6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ApobrQ8VBT6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ApobrQ8VBT6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ApobrQ8VBT6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ApobrQ8VBT6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ApobrQ8VBT6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ApobrQ8VBT6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ApobrQ8VBT6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ApobrQ8VBT6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ApobrQ8VBT6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ApobrQ8VBT6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ApobrQ8VBT6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ApobrQ8VBT6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ApobrQ8VBT6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ApobrQ8VBT6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ApobrQ8VBT6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ApobrQ8VBT6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ApobrQ8VBT6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ApobrQ8VBT6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ApobrQ8VBT6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ApobrQ8VBT6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ApobrQ8VBT6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ApobrQ8VBT6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ApobrQ8VBT6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ApobrQ8VBT6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ApobrQ8VBT6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms