Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2K8

Uncharacterized protein C1orf54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8R2K8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q8R2K8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q8R2K8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q8R2K8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q8R2K8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q8R2K8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Q8R2K8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Q8R2K8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q8R2K8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q8R2K8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q8R2K8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q8R2K8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q8R2K8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q8R2K8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q8R2K8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q8R2K8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Q8R2K8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q8R2K8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q8R2K8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q8R2K8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q8R2K8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q8R2K8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q8R2K8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q8R2K8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q8R2K8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q8R2K8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q8R2K8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q8R2K8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q8R2K8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q8R2K8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q8R2K8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Q8R2K8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8R2K8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8R2K8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8R2K8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8R2K8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8R2K8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8R2K8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8R2K8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8R2K8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8R2K8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8R2K8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8R2K8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8R2K8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8R2K8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8R2K8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8R2K8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8R2K8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8R2K8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8R2K8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8R2K8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8R2K8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8R2K8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8R2K8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8R2K8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8R2K8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8R2K8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8R2K8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8R2K8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8R2K8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8R2K8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8R2K8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8R2K8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8R2K8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8R2K8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8R2K8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8R2K8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8R2K8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8R2K8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8R2K8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8R2K8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8R2K8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Q8R2K8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8R2K8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8R2K8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8R2K8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8R2K8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8R2K8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8R2K8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8R2K8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8R2K8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8R2K8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8R2K8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8R2K8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8R2K8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8R2K8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8R2K8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8R2K8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8R2K8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8R2K8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8R2K8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8R2K8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8R2K8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8R2K8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8R2K8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8R2K8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8R2K8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8R2K8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8R2K8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8R2K8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms