Protein–RNA interactions for Protein: Q8K467

Tmie, Transmembrane inner ear expressed protein, mousemouse

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmieQ8K467 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TmieQ8K467 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TmieQ8K467 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TmieQ8K467 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TmieQ8K467 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TmieQ8K467 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TmieQ8K467 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TmieQ8K467 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TmieQ8K467 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TmieQ8K467 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TmieQ8K467 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TmieQ8K467 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TmieQ8K467 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TmieQ8K467 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TmieQ8K467 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TmieQ8K467 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TmieQ8K467 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TmieQ8K467 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TmieQ8K467 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TmieQ8K467 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TmieQ8K467 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TmieQ8K467 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TmieQ8K467 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TmieQ8K467 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TmieQ8K467 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TmieQ8K467 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TmieQ8K467 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TmieQ8K467 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TmieQ8K467 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TmieQ8K467 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TmieQ8K467 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TmieQ8K467 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TmieQ8K467 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TmieQ8K467 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TmieQ8K467 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TmieQ8K467 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TmieQ8K467 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TmieQ8K467 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TmieQ8K467 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TmieQ8K467 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TmieQ8K467 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TmieQ8K467 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TmieQ8K467 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TmieQ8K467 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TmieQ8K467 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TmieQ8K467 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TmieQ8K467 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TmieQ8K467 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TmieQ8K467 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TmieQ8K467 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TmieQ8K467 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TmieQ8K467 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TmieQ8K467 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TmieQ8K467 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TmieQ8K467 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TmieQ8K467 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TmieQ8K467 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TmieQ8K467 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TmieQ8K467 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TmieQ8K467 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TmieQ8K467 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TmieQ8K467 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TmieQ8K467 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TmieQ8K467 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TmieQ8K467 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TmieQ8K467 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TmieQ8K467 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TmieQ8K467 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TmieQ8K467 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TmieQ8K467 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TmieQ8K467 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TmieQ8K467 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TmieQ8K467 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TmieQ8K467 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TmieQ8K467 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TmieQ8K467 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TmieQ8K467 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TmieQ8K467 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TmieQ8K467 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TmieQ8K467 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TmieQ8K467 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TmieQ8K467 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TmieQ8K467 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TmieQ8K467 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TmieQ8K467 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TmieQ8K467 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TmieQ8K467 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TmieQ8K467 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TmieQ8K467 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TmieQ8K467 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TmieQ8K467 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TmieQ8K467 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TmieQ8K467 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TmieQ8K467 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TmieQ8K467 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TmieQ8K467 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TmieQ8K467 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TmieQ8K467 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TmieQ8K467 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TmieQ8K467 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 235.9 ms