Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rdh16f2Q8K3M1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rdh16f2Q8K3M1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rdh16f2Q8K3M1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rdh16f2Q8K3M1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rdh16f2Q8K3M1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rdh16f2Q8K3M1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rdh16f2Q8K3M1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rdh16f2Q8K3M1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rdh16f2Q8K3M1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rdh16f2Q8K3M1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rdh16f2Q8K3M1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rdh16f2Q8K3M1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rdh16f2Q8K3M1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rdh16f2Q8K3M1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rdh16f2Q8K3M1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rdh16f2Q8K3M1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rdh16f2Q8K3M1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rdh16f2Q8K3M1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rdh16f2Q8K3M1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rdh16f2Q8K3M1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rdh16f2Q8K3M1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rdh16f2Q8K3M1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rdh16f2Q8K3M1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rdh16f2Q8K3M1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rdh16f2Q8K3M1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rdh16f2Q8K3M1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rdh16f2Q8K3M1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rdh16f2Q8K3M1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rdh16f2Q8K3M1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rdh16f2Q8K3M1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rdh16f2Q8K3M1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rdh16f2Q8K3M1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rdh16f2Q8K3M1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rdh16f2Q8K3M1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rdh16f2Q8K3M1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rdh16f2Q8K3M1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rdh16f2Q8K3M1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rdh16f2Q8K3M1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rdh16f2Q8K3M1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rdh16f2Q8K3M1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rdh16f2Q8K3M1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rdh16f2Q8K3M1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rdh16f2Q8K3M1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rdh16f2Q8K3M1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rdh16f2Q8K3M1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rdh16f2Q8K3M1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rdh16f2Q8K3M1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rdh16f2Q8K3M1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rdh16f2Q8K3M1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rdh16f2Q8K3M1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rdh16f2Q8K3M1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rdh16f2Q8K3M1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 176.8 ms