Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrtm1Q8K377 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrtm1Q8K377 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrtm1Q8K377 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrtm1Q8K377 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrtm1Q8K377 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrtm1Q8K377 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrtm1Q8K377 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrtm1Q8K377 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrtm1Q8K377 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrtm1Q8K377 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrtm1Q8K377 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrtm1Q8K377 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrtm1Q8K377 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrtm1Q8K377 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrtm1Q8K377 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrtm1Q8K377 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrtm1Q8K377 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrtm1Q8K377 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrtm1Q8K377 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrtm1Q8K377 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms