Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FgbQ8K0E8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FgbQ8K0E8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FgbQ8K0E8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FgbQ8K0E8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FgbQ8K0E8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FgbQ8K0E8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FgbQ8K0E8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FgbQ8K0E8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FgbQ8K0E8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FgbQ8K0E8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FgbQ8K0E8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FgbQ8K0E8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FgbQ8K0E8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FgbQ8K0E8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FgbQ8K0E8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FgbQ8K0E8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FgbQ8K0E8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FgbQ8K0E8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FgbQ8K0E8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FgbQ8K0E8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FgbQ8K0E8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FgbQ8K0E8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FgbQ8K0E8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FgbQ8K0E8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FgbQ8K0E8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FgbQ8K0E8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FgbQ8K0E8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FgbQ8K0E8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FgbQ8K0E8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FgbQ8K0E8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FgbQ8K0E8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FgbQ8K0E8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FgbQ8K0E8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FgbQ8K0E8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FgbQ8K0E8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FgbQ8K0E8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FgbQ8K0E8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FgbQ8K0E8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FgbQ8K0E8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FgbQ8K0E8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FgbQ8K0E8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FgbQ8K0E8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FgbQ8K0E8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FgbQ8K0E8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FgbQ8K0E8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FgbQ8K0E8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FgbQ8K0E8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FgbQ8K0E8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FgbQ8K0E8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FgbQ8K0E8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FgbQ8K0E8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FgbQ8K0E8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FgbQ8K0E8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FgbQ8K0E8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FgbQ8K0E8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FgbQ8K0E8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FgbQ8K0E8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FgbQ8K0E8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FgbQ8K0E8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FgbQ8K0E8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FgbQ8K0E8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FgbQ8K0E8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FgbQ8K0E8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FgbQ8K0E8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FgbQ8K0E8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FgbQ8K0E8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FgbQ8K0E8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FgbQ8K0E8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FgbQ8K0E8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FgbQ8K0E8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FgbQ8K0E8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FgbQ8K0E8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FgbQ8K0E8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FgbQ8K0E8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FgbQ8K0E8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FgbQ8K0E8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FgbQ8K0E8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FgbQ8K0E8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FgbQ8K0E8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FgbQ8K0E8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FgbQ8K0E8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FgbQ8K0E8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FgbQ8K0E8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FgbQ8K0E8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FgbQ8K0E8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FgbQ8K0E8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FgbQ8K0E8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FgbQ8K0E8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FgbQ8K0E8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FgbQ8K0E8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FgbQ8K0E8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FgbQ8K0E8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FgbQ8K0E8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FgbQ8K0E8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FgbQ8K0E8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FgbQ8K0E8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FgbQ8K0E8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FgbQ8K0E8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FgbQ8K0E8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms