Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGU1

Calcoco1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco1Q8CGU1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Calcoco1Q8CGU1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Calcoco1Q8CGU1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Calcoco1Q8CGU1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Calcoco1Q8CGU1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Calcoco1Q8CGU1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Calcoco1Q8CGU1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Calcoco1Q8CGU1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calcoco1Q8CGU1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calcoco1Q8CGU1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calcoco1Q8CGU1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calcoco1Q8CGU1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calcoco1Q8CGU1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calcoco1Q8CGU1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calcoco1Q8CGU1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calcoco1Q8CGU1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Calcoco1Q8CGU1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calcoco1Q8CGU1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calcoco1Q8CGU1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calcoco1Q8CGU1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calcoco1Q8CGU1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calcoco1Q8CGU1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calcoco1Q8CGU1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calcoco1Q8CGU1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calcoco1Q8CGU1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calcoco1Q8CGU1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Calcoco1Q8CGU1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calcoco1Q8CGU1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calcoco1Q8CGU1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calcoco1Q8CGU1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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