Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD60

UPF0583 protein C15orf59 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CD60 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8CD60 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8CD60 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8CD60 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8CD60 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8CD60 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8CD60 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8CD60 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8CD60 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8CD60 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8CD60 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8CD60 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8CD60 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8CD60 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8CD60 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8CD60 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8CD60 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8CD60 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8CD60 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8CD60 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q8CD60 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q8CD60 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q8CD60 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q8CD60 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q8CD60 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Q8CD60 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Q8CD60 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q8CD60 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q8CD60 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8CD60 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8CD60 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8CD60 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8CD60 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8CD60 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8CD60 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8CD60 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8CD60 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8CD60 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8CD60 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8CD60 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8CD60 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8CD60 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8CD60 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8CD60 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8CD60 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8CD60 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8CD60 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8CD60 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8CD60 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8CD60 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8CD60 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8CD60 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8CD60 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8CD60 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8CD60 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8CD60 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8CD60 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8CD60 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8CD60 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8CD60 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8CD60 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8CD60 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8CD60 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q8CD60 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q8CD60 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q8CD60 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q8CD60 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8CD60 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8CD60 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8CD60 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8CD60 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8CD60 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8CD60 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8CD60 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8CD60 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8CD60 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8CD60 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8CD60 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8CD60 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8CD60 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8CD60 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8CD60 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8CD60 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8CD60 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8CD60 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8CD60 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8CD60 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8CD60 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8CD60 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8CD60 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8CD60 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8CD60 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8CD60 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8CD60 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8CD60 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8CD60 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8CD60 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8CD60 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8CD60 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8CD60 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms