Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lancl3Q8CD19 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lancl3Q8CD19 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lancl3Q8CD19 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lancl3Q8CD19 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lancl3Q8CD19 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lancl3Q8CD19 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lancl3Q8CD19 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lancl3Q8CD19 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lancl3Q8CD19 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lancl3Q8CD19 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lancl3Q8CD19 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lancl3Q8CD19 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lancl3Q8CD19 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lancl3Q8CD19 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lancl3Q8CD19 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lancl3Q8CD19 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lancl3Q8CD19 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lancl3Q8CD19 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lancl3Q8CD19 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lancl3Q8CD19 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lancl3Q8CD19 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Lancl3Q8CD19 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lancl3Q8CD19 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lancl3Q8CD19 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lancl3Q8CD19 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lancl3Q8CD19 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lancl3Q8CD19 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lancl3Q8CD19 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lancl3Q8CD19 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lancl3Q8CD19 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lancl3Q8CD19 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lancl3Q8CD19 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lancl3Q8CD19 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lancl3Q8CD19 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lancl3Q8CD19 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lancl3Q8CD19 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lancl3Q8CD19 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lancl3Q8CD19 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lancl3Q8CD19 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lancl3Q8CD19 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lancl3Q8CD19 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lancl3Q8CD19 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lancl3Q8CD19 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lancl3Q8CD19 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lancl3Q8CD19 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lancl3Q8CD19 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lancl3Q8CD19 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lancl3Q8CD19 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lancl3Q8CD19 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lancl3Q8CD19 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lancl3Q8CD19 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lancl3Q8CD19 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lancl3Q8CD19 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lancl3Q8CD19 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lancl3Q8CD19 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lancl3Q8CD19 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lancl3Q8CD19 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lancl3Q8CD19 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lancl3Q8CD19 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lancl3Q8CD19 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lancl3Q8CD19 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Lancl3Q8CD19 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lancl3Q8CD19 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lancl3Q8CD19 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lancl3Q8CD19 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lancl3Q8CD19 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lancl3Q8CD19 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lancl3Q8CD19 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lancl3Q8CD19 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lancl3Q8CD19 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lancl3Q8CD19 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lancl3Q8CD19 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lancl3Q8CD19 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lancl3Q8CD19 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lancl3Q8CD19 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lancl3Q8CD19 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lancl3Q8CD19 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lancl3Q8CD19 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lancl3Q8CD19 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lancl3Q8CD19 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lancl3Q8CD19 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lancl3Q8CD19 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lancl3Q8CD19 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lancl3Q8CD19 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lancl3Q8CD19 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lancl3Q8CD19 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lancl3Q8CD19 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lancl3Q8CD19 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lancl3Q8CD19 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lancl3Q8CD19 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lancl3Q8CD19 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lancl3Q8CD19 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lancl3Q8CD19 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lancl3Q8CD19 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lancl3Q8CD19 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lancl3Q8CD19 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lancl3Q8CD19 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lancl3Q8CD19 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lancl3Q8CD19 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms