Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC88

Vwa8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa8Q8CC88 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vwa8Q8CC88 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vwa8Q8CC88 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Vwa8Q8CC88 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vwa8Q8CC88 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Vwa8Q8CC88 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vwa8Q8CC88 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vwa8Q8CC88 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vwa8Q8CC88 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vwa8Q8CC88 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vwa8Q8CC88 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vwa8Q8CC88 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vwa8Q8CC88 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vwa8Q8CC88 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vwa8Q8CC88 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vwa8Q8CC88 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vwa8Q8CC88 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vwa8Q8CC88 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vwa8Q8CC88 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vwa8Q8CC88 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vwa8Q8CC88 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vwa8Q8CC88 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vwa8Q8CC88 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vwa8Q8CC88 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Vwa8Q8CC88 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vwa8Q8CC88 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vwa8Q8CC88 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vwa8Q8CC88 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vwa8Q8CC88 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vwa8Q8CC88 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vwa8Q8CC88 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vwa8Q8CC88 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Vwa8Q8CC88 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vwa8Q8CC88 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vwa8Q8CC88 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vwa8Q8CC88 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vwa8Q8CC88 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vwa8Q8CC88 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vwa8Q8CC88 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vwa8Q8CC88 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vwa8Q8CC88 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vwa8Q8CC88 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vwa8Q8CC88 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vwa8Q8CC88 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vwa8Q8CC88 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vwa8Q8CC88 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vwa8Q8CC88 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vwa8Q8CC88 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vwa8Q8CC88 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vwa8Q8CC88 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vwa8Q8CC88 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vwa8Q8CC88 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vwa8Q8CC88 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vwa8Q8CC88 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vwa8Q8CC88 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vwa8Q8CC88 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vwa8Q8CC88 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vwa8Q8CC88 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vwa8Q8CC88 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vwa8Q8CC88 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vwa8Q8CC88 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vwa8Q8CC88 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vwa8Q8CC88 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vwa8Q8CC88 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vwa8Q8CC88 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vwa8Q8CC88 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vwa8Q8CC88 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vwa8Q8CC88 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vwa8Q8CC88 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vwa8Q8CC88 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vwa8Q8CC88 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vwa8Q8CC88 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vwa8Q8CC88 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Vwa8Q8CC88 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vwa8Q8CC88 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vwa8Q8CC88 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vwa8Q8CC88 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vwa8Q8CC88 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vwa8Q8CC88 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Vwa8Q8CC88 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vwa8Q8CC88 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vwa8Q8CC88 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vwa8Q8CC88 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vwa8Q8CC88 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vwa8Q8CC88 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vwa8Q8CC88 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vwa8Q8CC88 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vwa8Q8CC88 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vwa8Q8CC88 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vwa8Q8CC88 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vwa8Q8CC88 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vwa8Q8CC88 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vwa8Q8CC88 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vwa8Q8CC88 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Vwa8Q8CC88 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vwa8Q8CC88 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vwa8Q8CC88 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Vwa8Q8CC88 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Vwa8Q8CC88 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vwa8Q8CC88 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms