Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacnb2Q8CC27 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacnb2Q8CC27 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacnb2Q8CC27 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacnb2Q8CC27 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacnb2Q8CC27 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacnb2Q8CC27 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacnb2Q8CC27 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacnb2Q8CC27 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacnb2Q8CC27 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacnb2Q8CC27 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacnb2Q8CC27 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacnb2Q8CC27 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacnb2Q8CC27 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacnb2Q8CC27 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacnb2Q8CC27 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacnb2Q8CC27 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacnb2Q8CC27 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacnb2Q8CC27 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacnb2Q8CC27 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacnb2Q8CC27 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacnb2Q8CC27 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cacnb2Q8CC27 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacnb2Q8CC27 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacnb2Q8CC27 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacnb2Q8CC27 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacnb2Q8CC27 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacnb2Q8CC27 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacnb2Q8CC27 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacnb2Q8CC27 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacnb2Q8CC27 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacnb2Q8CC27 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacnb2Q8CC27 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacnb2Q8CC27 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacnb2Q8CC27 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacnb2Q8CC27 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacnb2Q8CC27 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacnb2Q8CC27 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacnb2Q8CC27 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacnb2Q8CC27 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacnb2Q8CC27 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacnb2Q8CC27 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacnb2Q8CC27 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacnb2Q8CC27 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacnb2Q8CC27 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacnb2Q8CC27 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacnb2Q8CC27 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacnb2Q8CC27 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacnb2Q8CC27 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacnb2Q8CC27 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacnb2Q8CC27 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacnb2Q8CC27 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacnb2Q8CC27 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacnb2Q8CC27 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacnb2Q8CC27 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacnb2Q8CC27 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacnb2Q8CC27 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacnb2Q8CC27 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacnb2Q8CC27 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacnb2Q8CC27 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacnb2Q8CC27 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacnb2Q8CC27 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacnb2Q8CC27 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cacnb2Q8CC27 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cacnb2Q8CC27 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cacnb2Q8CC27 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacnb2Q8CC27 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacnb2Q8CC27 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacnb2Q8CC27 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacnb2Q8CC27 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacnb2Q8CC27 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacnb2Q8CC27 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacnb2Q8CC27 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacnb2Q8CC27 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacnb2Q8CC27 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacnb2Q8CC27 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacnb2Q8CC27 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacnb2Q8CC27 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacnb2Q8CC27 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacnb2Q8CC27 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacnb2Q8CC27 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacnb2Q8CC27 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacnb2Q8CC27 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacnb2Q8CC27 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacnb2Q8CC27 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacnb2Q8CC27 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacnb2Q8CC27 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacnb2Q8CC27 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacnb2Q8CC27 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacnb2Q8CC27 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacnb2Q8CC27 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacnb2Q8CC27 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacnb2Q8CC27 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacnb2Q8CC27 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacnb2Q8CC27 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacnb2Q8CC27 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacnb2Q8CC27 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacnb2Q8CC27 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacnb2Q8CC27 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacnb2Q8CC27 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms