Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB19

Phtf2, Putative homeodomain transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf2Q8CB19 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Phtf2Q8CB19 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Phtf2Q8CB19 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Phtf2Q8CB19 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Phtf2Q8CB19 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Phtf2Q8CB19 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Phtf2Q8CB19 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Phtf2Q8CB19 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Phtf2Q8CB19 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Phtf2Q8CB19 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Phtf2Q8CB19 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Phtf2Q8CB19 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Phtf2Q8CB19 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Phtf2Q8CB19 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Phtf2Q8CB19 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Phtf2Q8CB19 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Phtf2Q8CB19 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Phtf2Q8CB19 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Phtf2Q8CB19 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Phtf2Q8CB19 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Phtf2Q8CB19 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Phtf2Q8CB19 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Phtf2Q8CB19 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Phtf2Q8CB19 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Phtf2Q8CB19 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Phtf2Q8CB19 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Phtf2Q8CB19 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Phtf2Q8CB19 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Phtf2Q8CB19 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Phtf2Q8CB19 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Phtf2Q8CB19 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Phtf2Q8CB19 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Phtf2Q8CB19 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Phtf2Q8CB19 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Phtf2Q8CB19 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Phtf2Q8CB19 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Phtf2Q8CB19 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Phtf2Q8CB19 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Phtf2Q8CB19 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Phtf2Q8CB19 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Phtf2Q8CB19 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Phtf2Q8CB19 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Phtf2Q8CB19 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Phtf2Q8CB19 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Phtf2Q8CB19 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Phtf2Q8CB19 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Phtf2Q8CB19 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Phtf2Q8CB19 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Phtf2Q8CB19 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Phtf2Q8CB19 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Phtf2Q8CB19 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Phtf2Q8CB19 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Phtf2Q8CB19 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Phtf2Q8CB19 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Phtf2Q8CB19 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Phtf2Q8CB19 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Phtf2Q8CB19 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Phtf2Q8CB19 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Phtf2Q8CB19 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Phtf2Q8CB19 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Phtf2Q8CB19 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Phtf2Q8CB19 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Phtf2Q8CB19 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Phtf2Q8CB19 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Phtf2Q8CB19 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Phtf2Q8CB19 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Phtf2Q8CB19 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Phtf2Q8CB19 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Phtf2Q8CB19 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Phtf2Q8CB19 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Phtf2Q8CB19 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Phtf2Q8CB19 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Phtf2Q8CB19 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Phtf2Q8CB19 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Phtf2Q8CB19 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Phtf2Q8CB19 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Phtf2Q8CB19 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Phtf2Q8CB19 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Phtf2Q8CB19 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Phtf2Q8CB19 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Phtf2Q8CB19 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Phtf2Q8CB19 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Phtf2Q8CB19 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Phtf2Q8CB19 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Phtf2Q8CB19 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Phtf2Q8CB19 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Phtf2Q8CB19 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Phtf2Q8CB19 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Phtf2Q8CB19 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Phtf2Q8CB19 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Phtf2Q8CB19 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Phtf2Q8CB19 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Phtf2Q8CB19 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Phtf2Q8CB19 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Phtf2Q8CB19 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Phtf2Q8CB19 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Phtf2Q8CB19 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Phtf2Q8CB19 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Phtf2Q8CB19 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Phtf2Q8CB19 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms