Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAL5

Gpc5, Glypican-5, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc5Q8CAL5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gpc5Q8CAL5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpc5Q8CAL5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpc5Q8CAL5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpc5Q8CAL5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gpc5Q8CAL5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gpc5Q8CAL5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gpc5Q8CAL5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gpc5Q8CAL5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpc5Q8CAL5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpc5Q8CAL5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpc5Q8CAL5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpc5Q8CAL5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpc5Q8CAL5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpc5Q8CAL5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpc5Q8CAL5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpc5Q8CAL5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpc5Q8CAL5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpc5Q8CAL5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpc5Q8CAL5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpc5Q8CAL5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpc5Q8CAL5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpc5Q8CAL5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpc5Q8CAL5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpc5Q8CAL5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpc5Q8CAL5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpc5Q8CAL5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpc5Q8CAL5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpc5Q8CAL5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpc5Q8CAL5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Gpc5Q8CAL5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gpc5Q8CAL5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gpc5Q8CAL5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gpc5Q8CAL5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gpc5Q8CAL5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gpc5Q8CAL5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gpc5Q8CAL5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gpc5Q8CAL5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gpc5Q8CAL5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gpc5Q8CAL5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpc5Q8CAL5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpc5Q8CAL5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpc5Q8CAL5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpc5Q8CAL5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpc5Q8CAL5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpc5Q8CAL5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpc5Q8CAL5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpc5Q8CAL5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpc5Q8CAL5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpc5Q8CAL5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpc5Q8CAL5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpc5Q8CAL5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpc5Q8CAL5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpc5Q8CAL5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpc5Q8CAL5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpc5Q8CAL5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpc5Q8CAL5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpc5Q8CAL5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpc5Q8CAL5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpc5Q8CAL5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpc5Q8CAL5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpc5Q8CAL5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpc5Q8CAL5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpc5Q8CAL5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpc5Q8CAL5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpc5Q8CAL5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpc5Q8CAL5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpc5Q8CAL5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpc5Q8CAL5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpc5Q8CAL5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpc5Q8CAL5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpc5Q8CAL5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpc5Q8CAL5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpc5Q8CAL5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpc5Q8CAL5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gpc5Q8CAL5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gpc5Q8CAL5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gpc5Q8CAL5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gpc5Q8CAL5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gpc5Q8CAL5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gpc5Q8CAL5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpc5Q8CAL5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpc5Q8CAL5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpc5Q8CAL5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpc5Q8CAL5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpc5Q8CAL5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpc5Q8CAL5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpc5Q8CAL5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpc5Q8CAL5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpc5Q8CAL5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpc5Q8CAL5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpc5Q8CAL5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpc5Q8CAL5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpc5Q8CAL5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpc5Q8CAL5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpc5Q8CAL5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpc5Q8CAL5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpc5Q8CAL5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpc5Q8CAL5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpc5Q8CAL5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms