Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Spef2Q8C9J3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Spef2Q8C9J3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Spef2Q8C9J3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Spef2Q8C9J3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Spef2Q8C9J3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Spef2Q8C9J3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Spef2Q8C9J3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Spef2Q8C9J3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Spef2Q8C9J3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Spef2Q8C9J3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Spef2Q8C9J3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Spef2Q8C9J3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Spef2Q8C9J3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Spef2Q8C9J3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Spef2Q8C9J3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Spef2Q8C9J3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Spef2Q8C9J3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Spef2Q8C9J3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Spef2Q8C9J3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Spef2Q8C9J3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Spef2Q8C9J3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Spef2Q8C9J3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Spef2Q8C9J3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Spef2Q8C9J3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Spef2Q8C9J3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Spef2Q8C9J3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Spef2Q8C9J3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Spef2Q8C9J3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Spef2Q8C9J3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Spef2Q8C9J3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Spef2Q8C9J3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Spef2Q8C9J3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Spef2Q8C9J3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Spef2Q8C9J3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Spef2Q8C9J3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Spef2Q8C9J3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Spef2Q8C9J3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Spef2Q8C9J3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Spef2Q8C9J3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Spef2Q8C9J3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Spef2Q8C9J3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Spef2Q8C9J3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Spef2Q8C9J3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Spef2Q8C9J3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Spef2Q8C9J3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Spef2Q8C9J3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Spef2Q8C9J3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Spef2Q8C9J3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Spef2Q8C9J3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Spef2Q8C9J3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Spef2Q8C9J3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Spef2Q8C9J3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Spef2Q8C9J3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Spef2Q8C9J3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Spef2Q8C9J3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Spef2Q8C9J3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Spef2Q8C9J3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Spef2Q8C9J3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Spef2Q8C9J3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Spef2Q8C9J3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Spef2Q8C9J3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Spef2Q8C9J3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Spef2Q8C9J3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Spef2Q8C9J3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Spef2Q8C9J3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Spef2Q8C9J3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Spef2Q8C9J3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Spef2Q8C9J3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Spef2Q8C9J3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Spef2Q8C9J3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Spef2Q8C9J3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Spef2Q8C9J3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Spef2Q8C9J3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Spef2Q8C9J3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Spef2Q8C9J3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Spef2Q8C9J3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Spef2Q8C9J3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Spef2Q8C9J3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Spef2Q8C9J3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Spef2Q8C9J3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Spef2Q8C9J3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Spef2Q8C9J3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Spef2Q8C9J3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Spef2Q8C9J3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Spef2Q8C9J3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Spef2Q8C9J3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Spef2Q8C9J3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Spef2Q8C9J3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Spef2Q8C9J3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Spef2Q8C9J3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Spef2Q8C9J3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Spef2Q8C9J3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Spef2Q8C9J3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Spef2Q8C9J3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Spef2Q8C9J3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Spef2Q8C9J3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Spef2Q8C9J3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Spef2Q8C9J3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Spef2Q8C9J3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms