Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9C9

4930507D05Rik, RIKEN cDNA 4930507D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930507D05RikQ8C9C9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930507D05RikQ8C9C9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms