Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppfibp1Q8C8U0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppfibp1Q8C8U0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ppfibp1Q8C8U0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ppfibp1Q8C8U0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ppfibp1Q8C8U0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ppfibp1Q8C8U0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppfibp1Q8C8U0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppfibp1Q8C8U0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppfibp1Q8C8U0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppfibp1Q8C8U0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppfibp1Q8C8U0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppfibp1Q8C8U0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppfibp1Q8C8U0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppfibp1Q8C8U0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppfibp1Q8C8U0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppfibp1Q8C8U0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppfibp1Q8C8U0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppfibp1Q8C8U0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppfibp1Q8C8U0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppfibp1Q8C8U0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppfibp1Q8C8U0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppfibp1Q8C8U0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppfibp1Q8C8U0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppfibp1Q8C8U0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppfibp1Q8C8U0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppfibp1Q8C8U0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppfibp1Q8C8U0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppfibp1Q8C8U0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppfibp1Q8C8U0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppfibp1Q8C8U0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppfibp1Q8C8U0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppfibp1Q8C8U0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppfibp1Q8C8U0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfibp1Q8C8U0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfibp1Q8C8U0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfibp1Q8C8U0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfibp1Q8C8U0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfibp1Q8C8U0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfibp1Q8C8U0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfibp1Q8C8U0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppfibp1Q8C8U0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppfibp1Q8C8U0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppfibp1Q8C8U0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ppfibp1Q8C8U0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ppfibp1Q8C8U0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppfibp1Q8C8U0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppfibp1Q8C8U0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppfibp1Q8C8U0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppfibp1Q8C8U0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppfibp1Q8C8U0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppfibp1Q8C8U0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppfibp1Q8C8U0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppfibp1Q8C8U0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppfibp1Q8C8U0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppfibp1Q8C8U0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppfibp1Q8C8U0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppfibp1Q8C8U0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppfibp1Q8C8U0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppfibp1Q8C8U0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppfibp1Q8C8U0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppfibp1Q8C8U0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppfibp1Q8C8U0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppfibp1Q8C8U0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppfibp1Q8C8U0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppfibp1Q8C8U0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppfibp1Q8C8U0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppfibp1Q8C8U0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppfibp1Q8C8U0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppfibp1Q8C8U0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppfibp1Q8C8U0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfibp1Q8C8U0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfibp1Q8C8U0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfibp1Q8C8U0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfibp1Q8C8U0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfibp1Q8C8U0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppfibp1Q8C8U0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppfibp1Q8C8U0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppfibp1Q8C8U0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppfibp1Q8C8U0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppfibp1Q8C8U0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppfibp1Q8C8U0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppfibp1Q8C8U0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfibp1Q8C8U0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfibp1Q8C8U0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfibp1Q8C8U0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfibp1Q8C8U0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfibp1Q8C8U0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfibp1Q8C8U0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfibp1Q8C8U0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfibp1Q8C8U0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppfibp1Q8C8U0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppfibp1Q8C8U0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms