Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7I4

Apol9b, Apolipoprotein L 9b, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9bQ8C7I4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apol9bQ8C7I4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apol9bQ8C7I4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apol9bQ8C7I4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apol9bQ8C7I4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apol9bQ8C7I4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apol9bQ8C7I4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apol9bQ8C7I4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apol9bQ8C7I4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apol9bQ8C7I4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apol9bQ8C7I4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Apol9bQ8C7I4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apol9bQ8C7I4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apol9bQ8C7I4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apol9bQ8C7I4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apol9bQ8C7I4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apol9bQ8C7I4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apol9bQ8C7I4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apol9bQ8C7I4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apol9bQ8C7I4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apol9bQ8C7I4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apol9bQ8C7I4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apol9bQ8C7I4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apol9bQ8C7I4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apol9bQ8C7I4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apol9bQ8C7I4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apol9bQ8C7I4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Apol9bQ8C7I4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apol9bQ8C7I4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apol9bQ8C7I4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apol9bQ8C7I4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apol9bQ8C7I4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apol9bQ8C7I4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apol9bQ8C7I4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Apol9bQ8C7I4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Apol9bQ8C7I4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apol9bQ8C7I4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apol9bQ8C7I4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apol9bQ8C7I4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apol9bQ8C7I4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apol9bQ8C7I4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apol9bQ8C7I4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apol9bQ8C7I4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apol9bQ8C7I4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apol9bQ8C7I4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apol9bQ8C7I4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apol9bQ8C7I4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apol9bQ8C7I4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apol9bQ8C7I4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apol9bQ8C7I4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Apol9bQ8C7I4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Apol9bQ8C7I4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms