Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Znf428Q8C1M2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Znf428Q8C1M2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Znf428Q8C1M2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Znf428Q8C1M2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Znf428Q8C1M2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Znf428Q8C1M2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Znf428Q8C1M2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Znf428Q8C1M2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Znf428Q8C1M2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Znf428Q8C1M2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Znf428Q8C1M2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Znf428Q8C1M2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Znf428Q8C1M2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Znf428Q8C1M2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Znf428Q8C1M2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Znf428Q8C1M2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Znf428Q8C1M2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Znf428Q8C1M2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Znf428Q8C1M2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Znf428Q8C1M2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Znf428Q8C1M2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Znf428Q8C1M2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Znf428Q8C1M2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Znf428Q8C1M2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Znf428Q8C1M2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Znf428Q8C1M2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Znf428Q8C1M2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Znf428Q8C1M2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Znf428Q8C1M2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Znf428Q8C1M2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Znf428Q8C1M2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Znf428Q8C1M2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Znf428Q8C1M2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Znf428Q8C1M2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Znf428Q8C1M2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Znf428Q8C1M2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Znf428Q8C1M2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Znf428Q8C1M2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Znf428Q8C1M2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Znf428Q8C1M2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Znf428Q8C1M2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Znf428Q8C1M2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Znf428Q8C1M2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Znf428Q8C1M2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Znf428Q8C1M2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Znf428Q8C1M2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Znf428Q8C1M2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Znf428Q8C1M2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Znf428Q8C1M2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Znf428Q8C1M2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Znf428Q8C1M2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Znf428Q8C1M2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Znf428Q8C1M2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Znf428Q8C1M2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Znf428Q8C1M2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Znf428Q8C1M2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Znf428Q8C1M2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Znf428Q8C1M2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Znf428Q8C1M2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Znf428Q8C1M2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Znf428Q8C1M2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Znf428Q8C1M2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Znf428Q8C1M2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Znf428Q8C1M2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Znf428Q8C1M2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Znf428Q8C1M2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Znf428Q8C1M2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Znf428Q8C1M2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Znf428Q8C1M2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Znf428Q8C1M2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Znf428Q8C1M2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Znf428Q8C1M2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Znf428Q8C1M2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Znf428Q8C1M2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Znf428Q8C1M2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Znf428Q8C1M2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Znf428Q8C1M2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Znf428Q8C1M2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Znf428Q8C1M2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Znf428Q8C1M2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Znf428Q8C1M2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Znf428Q8C1M2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Znf428Q8C1M2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Znf428Q8C1M2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Znf428Q8C1M2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Znf428Q8C1M2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Znf428Q8C1M2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Znf428Q8C1M2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Znf428Q8C1M2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Znf428Q8C1M2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Znf428Q8C1M2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Znf428Q8C1M2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Znf428Q8C1M2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Znf428Q8C1M2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Znf428Q8C1M2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Znf428Q8C1M2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Znf428Q8C1M2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Znf428Q8C1M2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Znf428Q8C1M2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
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